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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 札幌 | 44 | 72 | 21 | 9 | 14 | 51 | 39 | 12 |
| 2 | 東京V | 44 | 71 | 21 | 8 | 15 | 85 | 55 | 30 |
| 3 | 徳島 | 44 | 71 | 21 | 8 | 15 | 64 | 46 | 18 |
| 4 | 鳥栖 | 44 | 70 | 19 | 13 | 12 | 62 | 38 | 24 |
| 5 | 千葉 | 44 | 69 | 20 | 9 | 15 | 58 | 47 | 11 |
| 6 | 栃木 | 44 | 66 | 18 | 12 | 14 | 54 | 48 | 6 |
| 7 | 群馬 | 44 | 66 | 20 | 6 | 18 | 52 | 60 | -8 |
| 8 | 大分 | 44 | 61 | 15 | 16 | 13 | 46 | 47 | -1 |
| 9 | 愛媛 | 44 | 61 | 16 | 13 | 15 | 48 | 53 | -5 |
| 10 | 横浜F | 44 | 60 | 16 | 12 | 16 | 52 | 51 | 1 |
| 11 | 熊本 | 44 | 60 | 15 | 15 | 14 | 43 | 53 | -10 |
| 12 | F東京 | 28 | 54 | 16 | 6 | 6 | 47 | 17 | 30 |
| 13 | 岡山 | 44 | 47 | 12 | 11 | 21 | 49 | 74 | -25 |
| 14 | 水戸 | 45 | 44 | 10 | 14 | 21 | 41 | 62 | -21 |
| 15 | 北九州 | 44 | 44 | 11 | 11 | 22 | 38 | 72 | -34 |
| 16 | 京都 | 28 | 39 | 11 | 6 | 11 | 35 | 34 | 1 |
| 17 | 湘南 | 28 | 39 | 10 | 9 | 9 | 30 | 32 | -2 |
| 18 | 富山 | 44 | 37 | 9 | 10 | 25 | 40 | 74 | -34 |
| 19 | 岐阜 | 44 | 37 | 10 | 7 | 27 | 37 | 74 | -37 |
| 20 | 福岡 | 17 | 36 | 11 | 3 | 3 | 32 | 18 | 14 |
| 21 | 柏 | 16 | 35 | 10 | 5 | 1 | 35 | 11 | 24 |
| 22 | 甲府 | 16 | 27 | 6 | 9 | 1 | 35 | 20 | 15 |
| 23 | 鳥取 | 28 | 24 | 6 | 6 | 16 | 28 | 37 | -9 |
