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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 札幌 | 40 | 68 | 20 | 8 | 12 | 46 | 35 | 11 |
| 2 | 鳥栖 | 41 | 67 | 19 | 10 | 12 | 60 | 36 | 24 |
| 3 | 群馬 | 40 | 63 | 19 | 6 | 15 | 48 | 51 | -3 |
| 4 | 東京V | 40 | 62 | 18 | 8 | 14 | 72 | 49 | 23 |
| 5 | 栃木 | 40 | 62 | 17 | 11 | 12 | 50 | 44 | 6 |
| 6 | 徳島 | 40 | 61 | 18 | 7 | 15 | 50 | 39 | 11 |
| 7 | 千葉 | 40 | 60 | 17 | 9 | 14 | 51 | 46 | 5 |
| 8 | 愛媛 | 40 | 57 | 15 | 12 | 13 | 46 | 44 | 2 |
| 9 | 横浜F | 41 | 56 | 15 | 11 | 15 | 46 | 43 | 3 |
| 10 | 大分 | 40 | 56 | 14 | 14 | 12 | 42 | 42 | 0 |
| 11 | F東京 | 27 | 51 | 15 | 6 | 6 | 42 | 17 | 25 |
| 12 | 熊本 | 40 | 51 | 12 | 15 | 13 | 36 | 48 | -12 |
| 13 | 岡山 | 41 | 47 | 12 | 11 | 18 | 48 | 67 | -19 |
| 14 | 水戸 | 41 | 43 | 10 | 13 | 18 | 38 | 52 | -14 |
| 15 | 北九州 | 40 | 43 | 11 | 10 | 19 | 33 | 59 | -26 |
| 16 | 京都 | 27 | 36 | 10 | 6 | 11 | 32 | 33 | -1 |
| 17 | 湘南 | 27 | 36 | 9 | 9 | 9 | 27 | 30 | -3 |
| 18 | 富山 | 40 | 33 | 8 | 9 | 23 | 34 | 67 | -33 |
| 19 | 岐阜 | 40 | 31 | 8 | 7 | 25 | 33 | 67 | -34 |
| 20 | 福岡 | 14 | 29 | 9 | 2 | 3 | 23 | 15 | 8 |
| 21 | 柏 | 13 | 28 | 8 | 4 | 1 | 28 | 9 | 19 |
| 22 | 甲府 | 13 | 24 | 6 | 6 | 1 | 28 | 13 | 15 |
| 23 | 鳥取 | 27 | 24 | 6 | 6 | 15 | 28 | 35 | -7 |
