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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 札幌 | 33 | 58 | 17 | 7 | 9 | 40 | 26 | 14 |
| 2 | 鳥栖 | 33 | 54 | 15 | 9 | 9 | 48 | 27 | 21 |
| 3 | 徳島 | 33 | 54 | 16 | 6 | 11 | 40 | 30 | 10 |
| 4 | 栃木 | 32 | 53 | 15 | 8 | 9 | 43 | 33 | 10 |
| 5 | 千葉 | 33 | 52 | 15 | 7 | 11 | 41 | 35 | 6 |
| 6 | 東京V | 32 | 51 | 15 | 6 | 11 | 58 | 39 | 19 |
| 7 | 群馬 | 33 | 50 | 15 | 5 | 13 | 43 | 46 | -3 |
| 8 | F東京 | 24 | 48 | 14 | 6 | 4 | 35 | 13 | 22 |
| 9 | 大分 | 33 | 45 | 11 | 12 | 10 | 34 | 35 | -1 |
| 10 | 熊本 | 32 | 45 | 11 | 12 | 9 | 28 | 33 | -5 |
| 11 | 愛媛 | 32 | 42 | 11 | 9 | 12 | 35 | 37 | -2 |
| 12 | 横浜F | 33 | 40 | 10 | 10 | 13 | 33 | 36 | -3 |
| 13 | 岡山 | 33 | 38 | 10 | 8 | 15 | 40 | 55 | -15 |
| 14 | 北九州 | 32 | 38 | 11 | 5 | 16 | 26 | 46 | -20 |
| 15 | 水戸 | 33 | 36 | 9 | 9 | 15 | 30 | 42 | -12 |
| 16 | 京都 | 24 | 33 | 9 | 6 | 9 | 28 | 24 | 4 |
| 17 | 湘南 | 24 | 32 | 8 | 8 | 8 | 23 | 26 | -3 |
| 18 | 富山 | 32 | 29 | 7 | 8 | 17 | 28 | 51 | -23 |
| 19 | 福岡 | 9 | 20 | 6 | 2 | 1 | 16 | 9 | 7 |
| 20 | 鳥取 | 24 | 20 | 5 | 5 | 14 | 24 | 31 | -7 |
| 21 | 岐阜 | 32 | 17 | 4 | 5 | 23 | 22 | 59 | -37 |
| 22 | 柏 | 8 | 15 | 4 | 3 | 1 | 15 | 4 | 11 |
| 23 | 甲府 | 8 | 13 | 3 | 4 | 1 | 16 | 9 | 7 |
