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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 千葉 | 48 | 80 | 24 | 8 | 16 | 73 | 50 | 23 |
| 2 | 鳥栖 | 48 | 78 | 22 | 12 | 14 | 73 | 50 | 23 |
| 3 | 東京V | 49 | 78 | 22 | 12 | 15 | 67 | 49 | 18 |
| 4 | 柏 | 34 | 76 | 22 | 10 | 2 | 69 | 23 | 46 |
| 5 | 栃木 | 48 | 75 | 22 | 9 | 17 | 66 | 54 | 12 |
| 6 | 群馬 | 48 | 72 | 21 | 9 | 18 | 56 | 62 | -6 |
| 7 | 熊本 | 48 | 72 | 19 | 15 | 14 | 46 | 52 | -6 |
| 8 | 甲府 | 34 | 69 | 19 | 12 | 3 | 69 | 36 | 33 |
| 9 | 札幌 | 48 | 68 | 18 | 14 | 16 | 53 | 47 | 6 |
| 10 | 徳島 | 48 | 67 | 20 | 7 | 21 | 60 | 61 | -1 |
| 11 | 愛媛 | 48 | 64 | 16 | 16 | 16 | 45 | 45 | 0 |
| 12 | 福岡 | 34 | 63 | 19 | 6 | 9 | 57 | 33 | 24 |
| 13 | 横浜F | 48 | 58 | 16 | 10 | 22 | 61 | 64 | -3 |
| 14 | 大分 | 48 | 58 | 14 | 16 | 18 | 50 | 60 | -10 |
| 15 | 水戸 | 48 | 50 | 11 | 17 | 20 | 37 | 60 | -23 |
| 16 | 岐阜 | 48 | 50 | 14 | 8 | 26 | 40 | 67 | -27 |
| 17 | 岡山 | 48 | 47 | 12 | 11 | 25 | 44 | 75 | -31 |
| 18 | 富山 | 49 | 40 | 11 | 7 | 31 | 47 | 88 | -41 |
| 19 | 北九州 | 48 | 37 | 7 | 16 | 25 | 32 | 75 | -43 |
| 20 | F東京 | 14 | 25 | 7 | 4 | 3 | 16 | 9 | 7 |
| 21 | 湘南 | 14 | 21 | 5 | 6 | 3 | 16 | 9 | 7 |
| 22 | 京都 | 14 | 16 | 4 | 4 | 6 | 12 | 13 | -1 |
| 23 | 鳥取 | 14 | 11 | 2 | 5 | 7 | 10 | 17 | -7 |
