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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 鳥栖 | 62 | 100 | 28 | 16 | 18 | 85 | 63 | 22 |
| 2 | 東京V | 62 | 97 | 28 | 13 | 21 | 87 | 70 | 17 |
| 3 | 甲府 | 50 | 96 | 27 | 15 | 8 | 90 | 54 | 36 |
| 4 | 熊本 | 62 | 96 | 26 | 18 | 18 | 65 | 65 | 0 |
| 5 | 福岡 | 50 | 94 | 28 | 10 | 12 | 79 | 45 | 34 |
| 6 | 群馬 | 62 | 91 | 27 | 10 | 25 | 68 | 82 | -14 |
| 7 | 札幌 | 62 | 90 | 24 | 18 | 20 | 71 | 64 | 7 |
| 8 | 徳島 | 62 | 89 | 26 | 11 | 25 | 80 | 68 | 12 |
| 9 | 栃木 | 62 | 85 | 24 | 13 | 25 | 74 | 72 | 2 |
| 10 | 横浜F | 62 | 82 | 23 | 13 | 26 | 78 | 79 | -1 |
| 11 | 柏 | 36 | 80 | 23 | 11 | 2 | 71 | 24 | 47 |
| 12 | 千葉 | 48 | 80 | 24 | 8 | 16 | 72 | 48 | 24 |
| 13 | 愛媛 | 62 | 69 | 16 | 21 | 25 | 52 | 64 | -12 |
| 14 | 岐阜 | 62 | 68 | 19 | 11 | 32 | 62 | 87 | -25 |
| 15 | 大分 | 48 | 60 | 15 | 15 | 18 | 52 | 60 | -8 |
| 16 | 水戸 | 62 | 60 | 14 | 18 | 30 | 49 | 87 | -38 |
| 17 | 岡山 | 62 | 51 | 13 | 12 | 37 | 51 | 101 | -50 |
| 18 | 富山 | 62 | 50 | 13 | 11 | 38 | 57 | 106 | -49 |
| 19 | 湘南 | 26 | 44 | 12 | 8 | 6 | 33 | 21 | 12 |
| 20 | 仙台 | 14 | 33 | 10 | 3 | 1 | 26 | 9 | 17 |
| 21 | 北九州 | 48 | 31 | 5 | 16 | 27 | 30 | 79 | -49 |
| 22 | C大阪 | 14 | 30 | 9 | 3 | 2 | 26 | 10 | 16 |
| 23 | F東京 | 12 | 21 | 6 | 3 | 3 | 11 | 7 | 4 |
| 24 | 京都 | 12 | 16 | 4 | 4 | 4 | 11 | 8 | 3 |
| 25 | 鳥取 | 12 | 9 | 2 | 3 | 7 | 9 | 16 | -7 |
