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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 熊本 | 52 | 83 | 23 | 14 | 15 | 54 | 54 | 0 |
| 2 | 鳥栖 | 52 | 81 | 22 | 15 | 15 | 72 | 55 | 17 |
| 3 | 東京V | 52 | 81 | 23 | 12 | 17 | 72 | 59 | 13 |
| 4 | 柏 | 36 | 80 | 23 | 11 | 2 | 71 | 24 | 47 |
| 5 | 甲府 | 41 | 79 | 22 | 13 | 6 | 79 | 47 | 32 |
| 6 | 福岡 | 41 | 79 | 24 | 7 | 10 | 72 | 40 | 32 |
| 7 | 千葉 | 47 | 77 | 23 | 8 | 16 | 70 | 47 | 23 |
| 8 | 栃木 | 52 | 74 | 21 | 11 | 20 | 66 | 62 | 4 |
| 9 | 群馬 | 52 | 73 | 21 | 10 | 21 | 57 | 69 | -12 |
| 10 | 札幌 | 52 | 71 | 18 | 17 | 17 | 60 | 56 | 4 |
| 11 | 横浜F | 52 | 70 | 20 | 10 | 22 | 68 | 68 | 0 |
| 12 | 徳島 | 52 | 69 | 20 | 9 | 23 | 62 | 65 | -3 |
| 13 | 愛媛 | 52 | 64 | 15 | 19 | 18 | 46 | 51 | -5 |
| 14 | 岐阜 | 52 | 59 | 17 | 8 | 27 | 52 | 76 | -24 |
| 15 | 水戸 | 52 | 58 | 14 | 16 | 22 | 46 | 68 | -22 |
| 16 | 大分 | 47 | 57 | 14 | 15 | 18 | 51 | 60 | -9 |
| 17 | 岡山 | 52 | 48 | 12 | 12 | 28 | 43 | 79 | -36 |
| 18 | 富山 | 52 | 44 | 12 | 8 | 32 | 50 | 91 | -41 |
| 19 | 北九州 | 47 | 31 | 5 | 16 | 26 | 30 | 75 | -45 |
| 20 | 湘南 | 16 | 22 | 5 | 7 | 4 | 20 | 15 | 5 |
| 21 | F東京 | 11 | 21 | 6 | 3 | 2 | 10 | 5 | 5 |
| 22 | 京都 | 11 | 15 | 4 | 3 | 4 | 11 | 8 | 3 |
| 23 | 仙台 | 5 | 13 | 4 | 1 | 0 | 11 | 1 | 10 |
| 24 | C大阪 | 5 | 9 | 3 | 0 | 2 | 11 | 4 | 7 |
| 25 | 鳥取 | 11 | 9 | 2 | 3 | 6 | 9 | 14 | -5 |
