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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 鳥栖 | 60 | 97 | 27 | 16 | 17 | 83 | 61 | 22 |
| 2 | 甲府 | 50 | 96 | 27 | 15 | 8 | 90 | 54 | 36 |
| 3 | 福岡 | 50 | 94 | 28 | 10 | 12 | 79 | 45 | 34 |
| 4 | 熊本 | 60 | 92 | 25 | 17 | 18 | 64 | 65 | -1 |
| 5 | 東京V | 60 | 91 | 26 | 13 | 21 | 80 | 69 | 11 |
| 6 | 群馬 | 60 | 88 | 26 | 10 | 24 | 65 | 79 | -14 |
| 7 | 札幌 | 60 | 87 | 23 | 18 | 19 | 69 | 63 | 6 |
| 8 | 徳島 | 60 | 83 | 24 | 11 | 25 | 77 | 67 | 10 |
| 9 | 栃木 | 60 | 82 | 23 | 13 | 24 | 72 | 70 | 2 |
| 10 | 横浜F | 60 | 81 | 23 | 12 | 25 | 76 | 76 | 0 |
| 11 | 柏 | 36 | 80 | 23 | 11 | 2 | 71 | 24 | 47 |
| 12 | 千葉 | 46 | 74 | 22 | 8 | 16 | 69 | 47 | 22 |
| 13 | 愛媛 | 60 | 68 | 16 | 20 | 24 | 51 | 62 | -11 |
| 14 | 岐阜 | 60 | 67 | 19 | 10 | 31 | 60 | 83 | -23 |
| 15 | 水戸 | 60 | 59 | 14 | 17 | 29 | 49 | 86 | -37 |
| 16 | 大分 | 46 | 57 | 14 | 15 | 17 | 50 | 58 | -8 |
| 17 | 富山 | 60 | 49 | 13 | 10 | 37 | 57 | 105 | -48 |
| 18 | 岡山 | 60 | 48 | 12 | 12 | 36 | 48 | 98 | -50 |
| 19 | 湘南 | 24 | 40 | 11 | 7 | 6 | 31 | 20 | 11 |
| 20 | 仙台 | 14 | 33 | 10 | 3 | 1 | 26 | 9 | 17 |
| 21 | C大阪 | 14 | 30 | 9 | 3 | 2 | 26 | 10 | 16 |
| 22 | 北九州 | 46 | 28 | 4 | 16 | 26 | 29 | 75 | -46 |
| 23 | F東京 | 10 | 18 | 5 | 3 | 2 | 9 | 5 | 4 |
| 24 | 京都 | 10 | 15 | 4 | 3 | 3 | 10 | 6 | 4 |
| 25 | 鳥取 | 10 | 9 | 2 | 3 | 5 | 9 | 13 | -4 |
