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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 甲府 | 53 | 103 | 29 | 16 | 8 | 93 | 55 | 38 |
| 2 | 福岡 | 53 | 98 | 29 | 11 | 13 | 84 | 49 | 35 |
| 3 | 鳥栖 | 54 | 85 | 23 | 16 | 15 | 66 | 56 | 10 |
| 4 | 熊本 | 54 | 81 | 22 | 15 | 17 | 62 | 65 | -3 |
| 5 | 柏 | 36 | 80 | 23 | 11 | 2 | 71 | 24 | 47 |
| 6 | 東京V | 54 | 79 | 23 | 10 | 21 | 67 | 60 | 7 |
| 7 | 札幌 | 54 | 75 | 19 | 18 | 17 | 65 | 61 | 4 |
| 8 | 横浜F | 54 | 75 | 22 | 9 | 23 | 74 | 72 | 2 |
| 9 | 徳島 | 54 | 74 | 21 | 11 | 22 | 71 | 60 | 11 |
| 10 | 群馬 | 54 | 71 | 21 | 8 | 25 | 56 | 80 | -24 |
| 11 | 愛媛 | 54 | 66 | 16 | 18 | 20 | 52 | 56 | -4 |
| 12 | 栃木 | 54 | 66 | 18 | 12 | 24 | 62 | 67 | -5 |
| 13 | 岐阜 | 54 | 66 | 19 | 9 | 26 | 60 | 72 | -12 |
| 14 | 千葉 | 37 | 64 | 19 | 7 | 11 | 61 | 37 | 24 |
| 15 | 水戸 | 54 | 55 | 13 | 16 | 25 | 47 | 80 | -33 |
| 16 | 大分 | 37 | 44 | 11 | 11 | 15 | 40 | 49 | -9 |
| 17 | 富山 | 54 | 44 | 12 | 8 | 34 | 54 | 95 | -41 |
| 18 | 仙台 | 17 | 40 | 12 | 4 | 1 | 31 | 11 | 20 |
| 19 | 岡山 | 54 | 40 | 10 | 10 | 34 | 41 | 90 | -49 |
| 20 | C大阪 | 17 | 36 | 11 | 3 | 3 | 29 | 11 | 18 |
| 21 | 湘南 | 18 | 35 | 10 | 5 | 3 | 28 | 15 | 13 |
| 22 | 北九州 | 37 | 15 | 1 | 12 | 24 | 20 | 68 | -48 |
| 23 | F東京 | 1 | 3 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 1 |
| 24 | 京都 | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 | 1 | 2 | -1 |
| 25 | 鳥取 | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 1 | -1 |
