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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 甲府 | 44 | 85 | 25 | 10 | 9 | 74 | 42 | 32 |
| 2 | 鳥栖 | 44 | 83 | 24 | 11 | 9 | 63 | 38 | 25 |
| 3 | 仙台 | 36 | 74 | 22 | 8 | 6 | 62 | 30 | 32 |
| 4 | C大阪 | 36 | 69 | 20 | 9 | 7 | 71 | 38 | 33 |
| 5 | 徳島 | 44 | 65 | 18 | 11 | 15 | 60 | 47 | 13 |
| 6 | 湘南 | 36 | 63 | 18 | 9 | 9 | 57 | 41 | 16 |
| 7 | 岐阜 | 45 | 62 | 17 | 11 | 17 | 59 | 57 | 2 |
| 8 | 札幌 | 44 | 62 | 16 | 14 | 14 | 57 | 55 | 2 |
| 9 | 水戸 | 45 | 61 | 17 | 10 | 18 | 50 | 61 | -11 |
| 10 | 東京V | 44 | 60 | 17 | 9 | 18 | 62 | 54 | 8 |
| 11 | 福岡 | 45 | 58 | 16 | 10 | 19 | 53 | 65 | -12 |
| 12 | 熊本 | 45 | 57 | 16 | 9 | 20 | 60 | 71 | -11 |
| 13 | 群馬 | 45 | 55 | 15 | 10 | 20 | 48 | 61 | -13 |
| 14 | 横浜F | 45 | 50 | 14 | 8 | 23 | 44 | 61 | -17 |
| 15 | 富山 | 44 | 45 | 11 | 12 | 21 | 40 | 67 | -27 |
| 16 | 愛媛 | 44 | 43 | 11 | 10 | 23 | 44 | 68 | -24 |
| 17 | 栃木 | 44 | 36 | 8 | 12 | 24 | 37 | 64 | -27 |
| 18 | 岡山 | 45 | 34 | 9 | 7 | 29 | 35 | 71 | -36 |
| 19 | 柏 | 8 | 20 | 6 | 2 | 0 | 12 | 3 | 9 |
| 20 | 千葉 | 9 | 17 | 5 | 2 | 2 | 18 | 9 | 9 |
| 21 | 大分 | 9 | 16 | 5 | 1 | 3 | 16 | 11 | 5 |
| 22 | 北九州 | 9 | 6 | 1 | 3 | 5 | 3 | 11 | -8 |
