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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 鳥栖 | 46 | 86 | 25 | 11 | 10 | 66 | 41 | 25 |
| 2 | 仙台 | 40 | 84 | 25 | 9 | 6 | 73 | 33 | 40 |
| 3 | 甲府 | 46 | 83 | 24 | 11 | 11 | 71 | 45 | 26 |
| 4 | C大阪 | 40 | 78 | 23 | 9 | 8 | 81 | 44 | 37 |
| 5 | 湘南 | 40 | 73 | 21 | 10 | 9 | 65 | 43 | 22 |
| 6 | 札幌 | 46 | 70 | 18 | 16 | 12 | 64 | 54 | 10 |
| 7 | 徳島 | 46 | 67 | 18 | 13 | 15 | 62 | 49 | 13 |
| 8 | 東京V | 46 | 65 | 18 | 11 | 17 | 60 | 53 | 7 |
| 9 | 岐阜 | 47 | 63 | 17 | 12 | 18 | 62 | 59 | 3 |
| 10 | 水戸 | 47 | 62 | 17 | 11 | 19 | 55 | 67 | -12 |
| 11 | 福岡 | 47 | 61 | 16 | 13 | 18 | 53 | 65 | -12 |
| 12 | 熊本 | 47 | 58 | 16 | 10 | 21 | 60 | 71 | -11 |
| 13 | 富山 | 46 | 54 | 14 | 12 | 20 | 44 | 66 | -22 |
| 14 | 群馬 | 47 | 50 | 13 | 11 | 23 | 50 | 72 | -22 |
| 15 | 横浜F | 47 | 47 | 13 | 8 | 26 | 45 | 65 | -20 |
| 16 | 愛媛 | 46 | 43 | 11 | 10 | 25 | 45 | 70 | -25 |
| 17 | 栃木 | 47 | 39 | 9 | 12 | 26 | 40 | 71 | -31 |
| 18 | 岡山 | 47 | 35 | 9 | 8 | 30 | 35 | 76 | -41 |
| 19 | 柏 | 7 | 17 | 5 | 2 | 0 | 9 | 2 | 7 |
| 20 | 大分 | 7 | 15 | 5 | 0 | 2 | 15 | 9 | 6 |
| 21 | 千葉 | 7 | 13 | 4 | 1 | 2 | 14 | 7 | 7 |
| 22 | 北九州 | 7 | 5 | 1 | 2 | 4 | 3 | 10 | -7 |
