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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 仙台 | 99 | 186 | 53 | 27 | 19 | 157 | 92 | 65 |
| 2 | C大阪 | 100 | 184 | 55 | 19 | 26 | 195 | 120 | 75 |
| 3 | 湘南 | 99 | 175 | 52 | 19 | 28 | 162 | 108 | 54 |
| 4 | 鳥栖 | 104 | 175 | 51 | 22 | 31 | 139 | 111 | 28 |
| 5 | 甲府 | 97 | 160 | 44 | 28 | 25 | 135 | 99 | 36 |
| 6 | 福岡 | 105 | 142 | 38 | 28 | 39 | 126 | 151 | -25 |
| 7 | 水戸 | 104 | 132 | 37 | 21 | 46 | 129 | 159 | -30 |
| 8 | 群馬 | 105 | 125 | 32 | 29 | 44 | 121 | 148 | -27 |
| 9 | 徳島 | 104 | 114 | 30 | 24 | 50 | 118 | 141 | -23 |
| 10 | 熊本 | 98 | 112 | 29 | 25 | 44 | 118 | 157 | -39 |
| 11 | 岐阜 | 98 | 110 | 28 | 26 | 44 | 109 | 147 | -38 |
| 12 | 横浜F | 98 | 103 | 25 | 28 | 45 | 102 | 130 | -28 |
| 13 | 広島 | 42 | 100 | 31 | 7 | 4 | 99 | 35 | 64 |
| 14 | 札幌 | 62 | 99 | 27 | 18 | 17 | 85 | 72 | 13 |
| 15 | 愛媛 | 104 | 91 | 23 | 22 | 59 | 100 | 160 | -60 |
| 16 | 東京V | 61 | 87 | 24 | 15 | 22 | 82 | 75 | 7 |
| 17 | 山形 | 48 | 82 | 24 | 10 | 14 | 68 | 48 | 20 |
| 18 | 富山 | 55 | 64 | 16 | 16 | 23 | 52 | 69 | -17 |
| 19 | 栃木 | 56 | 44 | 10 | 14 | 32 | 45 | 82 | -37 |
| 20 | 岡山 | 56 | 40 | 9 | 13 | 34 | 42 | 89 | -47 |
| 21 | 京都 | 7 | 14 | 4 | 2 | 1 | 11 | 8 | 3 |
| 22 | 柏 | 5 | 13 | 4 | 1 | 0 | 6 | 1 | 5 |
| 23 | 千葉 | 5 | 10 | 3 | 1 | 1 | 9 | 5 | 4 |
| 24 | 大分 | 5 | 9 | 3 | 0 | 2 | 11 | 8 | 3 |
| 25 | 北九州 | 5 | 4 | 1 | 1 | 3 | 2 | 8 | -6 |
