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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 甲府 | 47 | 92 | 26 | 14 | 7 | 85 | 49 | 36 |
| 2 | 福岡 | 46 | 84 | 25 | 9 | 12 | 74 | 44 | 30 |
| 3 | 東京V | 47 | 73 | 21 | 10 | 16 | 59 | 49 | 10 |
| 4 | 鳥栖 | 46 | 73 | 20 | 13 | 13 | 57 | 49 | 8 |
| 5 | 柏 | 32 | 72 | 21 | 9 | 2 | 63 | 22 | 41 |
| 6 | 熊本 | 46 | 70 | 19 | 13 | 14 | 53 | 54 | -1 |
| 7 | 横浜F | 46 | 68 | 20 | 8 | 18 | 67 | 61 | 6 |
| 8 | 札幌 | 46 | 63 | 16 | 15 | 15 | 51 | 52 | -1 |
| 9 | 徳島 | 46 | 61 | 17 | 10 | 19 | 65 | 56 | 9 |
| 10 | 岐阜 | 47 | 59 | 17 | 8 | 22 | 52 | 62 | -10 |
| 11 | 群馬 | 46 | 59 | 17 | 8 | 21 | 43 | 64 | -21 |
| 12 | 栃木 | 46 | 57 | 15 | 12 | 19 | 52 | 53 | -1 |
| 13 | 千葉 | 31 | 51 | 15 | 6 | 10 | 52 | 32 | 20 |
| 14 | 愛媛 | 46 | 50 | 11 | 17 | 18 | 37 | 48 | -11 |
| 15 | 水戸 | 46 | 41 | 9 | 14 | 23 | 35 | 69 | -34 |
| 16 | 大分 | 31 | 37 | 10 | 7 | 14 | 35 | 44 | -9 |
| 17 | 仙台 | 15 | 36 | 11 | 3 | 1 | 28 | 9 | 19 |
| 18 | 岡山 | 46 | 36 | 9 | 9 | 28 | 32 | 71 | -39 |
| 19 | C大阪 | 15 | 33 | 10 | 3 | 2 | 27 | 10 | 17 |
| 20 | 富山 | 46 | 33 | 9 | 6 | 31 | 45 | 84 | -39 |
| 21 | 湘南 | 15 | 28 | 8 | 4 | 3 | 21 | 14 | 7 |
| 22 | 北九州 | 32 | 15 | 1 | 12 | 19 | 19 | 56 | -37 |
