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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 甲府 | 46 | 89 | 25 | 14 | 7 | 78 | 48 | 30 |
| 2 | 福岡 | 45 | 81 | 24 | 9 | 12 | 69 | 40 | 29 |
| 3 | 鳥栖 | 45 | 73 | 20 | 13 | 12 | 58 | 47 | 11 |
| 4 | 東京V | 46 | 70 | 20 | 10 | 16 | 57 | 49 | 8 |
| 5 | 熊本 | 46 | 67 | 18 | 13 | 15 | 51 | 56 | -5 |
| 6 | 柏 | 30 | 66 | 19 | 9 | 2 | 56 | 21 | 35 |
| 7 | 横浜F | 45 | 65 | 19 | 8 | 18 | 66 | 61 | 5 |
| 8 | 札幌 | 45 | 63 | 16 | 15 | 14 | 55 | 53 | 2 |
| 9 | 徳島 | 45 | 61 | 17 | 10 | 18 | 63 | 53 | 10 |
| 10 | 岐阜 | 46 | 59 | 17 | 8 | 21 | 53 | 60 | -7 |
| 11 | 群馬 | 45 | 56 | 16 | 8 | 21 | 44 | 68 | -24 |
| 12 | 栃木 | 45 | 54 | 14 | 12 | 19 | 48 | 51 | -3 |
| 13 | 千葉 | 29 | 51 | 15 | 6 | 8 | 51 | 29 | 22 |
| 14 | 愛媛 | 46 | 50 | 11 | 17 | 18 | 39 | 49 | -10 |
| 15 | 水戸 | 45 | 44 | 10 | 14 | 21 | 38 | 66 | -28 |
| 16 | 仙台 | 16 | 39 | 12 | 3 | 1 | 30 | 10 | 20 |
| 17 | C大阪 | 16 | 36 | 11 | 3 | 2 | 29 | 10 | 19 |
| 18 | 大分 | 29 | 34 | 9 | 7 | 13 | 34 | 43 | -9 |
| 19 | 湘南 | 16 | 31 | 9 | 4 | 3 | 22 | 14 | 8 |
| 20 | 富山 | 45 | 30 | 8 | 6 | 31 | 41 | 81 | -40 |
| 21 | 岡山 | 45 | 30 | 7 | 9 | 29 | 31 | 74 | -43 |
| 22 | 北九州 | 30 | 15 | 1 | 12 | 17 | 18 | 48 | -30 |
