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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 仙台 | 46 | 99 | 30 | 9 | 7 | 85 | 37 | 48 |
| 2 | 甲府 | 49 | 91 | 26 | 13 | 10 | 75 | 48 | 27 |
| 3 | C大阪 | 46 | 89 | 26 | 11 | 9 | 90 | 50 | 40 |
| 4 | 鳥栖 | 48 | 85 | 24 | 13 | 11 | 69 | 47 | 22 |
| 5 | 湘南 | 46 | 83 | 24 | 11 | 11 | 77 | 50 | 27 |
| 6 | 札幌 | 49 | 79 | 21 | 16 | 12 | 72 | 59 | 13 |
| 7 | 徳島 | 49 | 74 | 20 | 14 | 15 | 67 | 50 | 17 |
| 8 | 東京V | 48 | 67 | 19 | 10 | 19 | 66 | 60 | 6 |
| 9 | 水戸 | 49 | 66 | 18 | 12 | 19 | 66 | 77 | -11 |
| 10 | 福岡 | 49 | 64 | 17 | 13 | 19 | 52 | 68 | -16 |
| 11 | 岐阜 | 49 | 59 | 15 | 14 | 20 | 62 | 70 | -8 |
| 12 | 熊本 | 49 | 59 | 16 | 11 | 22 | 65 | 76 | -11 |
| 13 | 富山 | 48 | 56 | 14 | 14 | 20 | 48 | 60 | -12 |
| 14 | 群馬 | 49 | 56 | 15 | 11 | 23 | 56 | 74 | -18 |
| 15 | 横浜F | 49 | 52 | 14 | 10 | 25 | 45 | 62 | -17 |
| 16 | 愛媛 | 49 | 41 | 10 | 11 | 28 | 46 | 77 | -31 |
| 17 | 栃木 | 49 | 38 | 8 | 14 | 27 | 39 | 74 | -35 |
| 18 | 岡山 | 49 | 36 | 9 | 9 | 31 | 39 | 82 | -43 |
| 19 | 柏 | 3 | 7 | 2 | 1 | 0 | 3 | 1 | 2 |
| 20 | 大分 | 3 | 6 | 2 | 0 | 1 | 7 | 4 | 3 |
| 21 | 千葉 | 3 | 4 | 1 | 1 | 1 | 4 | 4 | 0 |
| 22 | 北九州 | 3 | 3 | 1 | 0 | 2 | 2 | 5 | -3 |
