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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 甲府 | 39 | 76 | 22 | 10 | 7 | 67 | 45 | 22 |
| 2 | 福岡 | 38 | 71 | 21 | 8 | 9 | 61 | 32 | 29 |
| 3 | 鳥栖 | 38 | 63 | 17 | 12 | 9 | 47 | 38 | 9 |
| 4 | 熊本 | 39 | 63 | 17 | 12 | 10 | 47 | 43 | 4 |
| 5 | 柏 | 25 | 58 | 17 | 7 | 1 | 48 | 18 | 30 |
| 6 | 東京V | 39 | 58 | 16 | 10 | 13 | 47 | 41 | 6 |
| 7 | 徳島 | 39 | 57 | 16 | 9 | 14 | 58 | 45 | 13 |
| 8 | 札幌 | 39 | 54 | 14 | 12 | 13 | 45 | 44 | 1 |
| 9 | 横浜F | 38 | 51 | 15 | 6 | 17 | 53 | 54 | -1 |
| 10 | 群馬 | 38 | 48 | 14 | 6 | 18 | 38 | 58 | -20 |
| 11 | 岐阜 | 39 | 47 | 14 | 5 | 20 | 41 | 53 | -12 |
| 12 | 栃木 | 39 | 46 | 12 | 10 | 17 | 42 | 45 | -3 |
| 13 | 千葉 | 25 | 42 | 12 | 6 | 7 | 47 | 27 | 20 |
| 14 | 愛媛 | 39 | 40 | 9 | 13 | 17 | 31 | 44 | -13 |
| 15 | 水戸 | 38 | 36 | 9 | 9 | 20 | 30 | 59 | -29 |
| 16 | 仙台 | 14 | 33 | 10 | 3 | 1 | 26 | 9 | 17 |
| 17 | C大阪 | 14 | 30 | 9 | 3 | 2 | 26 | 10 | 16 |
| 18 | 富山 | 39 | 30 | 8 | 6 | 25 | 40 | 69 | -29 |
| 19 | 湘南 | 14 | 27 | 8 | 3 | 3 | 20 | 13 | 7 |
| 20 | 大分 | 24 | 26 | 7 | 5 | 12 | 30 | 39 | -9 |
| 21 | 岡山 | 38 | 24 | 6 | 6 | 26 | 22 | 59 | -37 |
| 22 | 北九州 | 25 | 14 | 1 | 11 | 13 | 17 | 38 | -21 |
