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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 甲府 | 52 | 99 | 28 | 15 | 9 | 84 | 58 | 26 |
| 2 | 福岡 | 51 | 88 | 25 | 13 | 13 | 78 | 55 | 23 |
| 3 | 鳥栖 | 51 | 88 | 24 | 16 | 11 | 71 | 51 | 20 |
| 4 | 札幌 | 52 | 75 | 20 | 15 | 17 | 68 | 61 | 7 |
| 5 | 東京V | 52 | 74 | 21 | 11 | 20 | 67 | 57 | 10 |
| 6 | 徳島 | 52 | 72 | 20 | 12 | 20 | 74 | 60 | 14 |
| 7 | 熊本 | 52 | 72 | 20 | 12 | 20 | 64 | 75 | -11 |
| 8 | 岐阜 | 52 | 69 | 20 | 9 | 23 | 61 | 70 | -9 |
| 9 | 水戸 | 51 | 66 | 18 | 12 | 21 | 55 | 67 | -12 |
| 10 | 横浜F | 51 | 62 | 18 | 8 | 25 | 63 | 74 | -11 |
| 11 | 群馬 | 51 | 59 | 16 | 11 | 24 | 51 | 77 | -26 |
| 12 | 柏 | 25 | 58 | 17 | 7 | 1 | 48 | 18 | 30 |
| 13 | 仙台 | 27 | 57 | 17 | 6 | 4 | 46 | 22 | 24 |
| 14 | 栃木 | 52 | 53 | 13 | 14 | 25 | 50 | 67 | -17 |
| 15 | C大阪 | 27 | 52 | 15 | 7 | 5 | 49 | 24 | 25 |
| 16 | 富山 | 52 | 52 | 14 | 10 | 28 | 55 | 80 | -25 |
| 17 | 愛媛 | 52 | 51 | 12 | 15 | 25 | 43 | 69 | -26 |
| 18 | 湘南 | 27 | 47 | 14 | 5 | 8 | 37 | 29 | 8 |
| 19 | 千葉 | 25 | 42 | 12 | 6 | 7 | 47 | 27 | 20 |
| 20 | 岡山 | 51 | 40 | 10 | 10 | 31 | 40 | 80 | -40 |
| 21 | 大分 | 24 | 26 | 7 | 5 | 12 | 30 | 39 | -9 |
| 22 | 北九州 | 25 | 14 | 1 | 11 | 13 | 17 | 38 | -21 |
