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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 甲府 | 54 | 102 | 29 | 15 | 10 | 89 | 58 | 31 |
| 2 | 鳥栖 | 53 | 92 | 25 | 17 | 11 | 75 | 53 | 22 |
| 3 | 福岡 | 53 | 85 | 24 | 13 | 16 | 76 | 65 | 11 |
| 4 | 東京V | 54 | 80 | 23 | 11 | 20 | 73 | 61 | 12 |
| 5 | 徳島 | 54 | 78 | 22 | 12 | 20 | 78 | 63 | 15 |
| 6 | 熊本 | 54 | 78 | 22 | 12 | 20 | 69 | 75 | -6 |
| 7 | 札幌 | 54 | 77 | 20 | 17 | 17 | 72 | 65 | 7 |
| 8 | 岐阜 | 54 | 73 | 21 | 10 | 23 | 65 | 73 | -8 |
| 9 | 水戸 | 53 | 69 | 19 | 12 | 22 | 57 | 70 | -13 |
| 10 | 横浜F | 53 | 63 | 18 | 9 | 26 | 63 | 76 | -13 |
| 11 | 仙台 | 30 | 62 | 18 | 8 | 4 | 51 | 26 | 25 |
| 12 | 群馬 | 53 | 60 | 16 | 12 | 25 | 53 | 79 | -26 |
| 13 | C大阪 | 30 | 58 | 17 | 7 | 6 | 56 | 30 | 26 |
| 14 | 柏 | 24 | 55 | 16 | 7 | 1 | 45 | 16 | 29 |
| 15 | 富山 | 54 | 54 | 14 | 12 | 28 | 56 | 80 | -24 |
| 16 | 栃木 | 54 | 53 | 13 | 14 | 27 | 52 | 72 | -20 |
| 17 | 湘南 | 30 | 51 | 15 | 6 | 9 | 42 | 34 | 8 |
| 18 | 愛媛 | 54 | 51 | 12 | 15 | 27 | 49 | 76 | -27 |
| 19 | 岡山 | 53 | 43 | 11 | 10 | 32 | 40 | 80 | -40 |
| 20 | 千葉 | 24 | 42 | 12 | 6 | 6 | 45 | 24 | 21 |
| 21 | 大分 | 24 | 26 | 7 | 5 | 12 | 30 | 39 | -9 |
| 22 | 北九州 | 24 | 13 | 1 | 10 | 13 | 15 | 36 | -21 |
