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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 甲府 | 39 | 76 | 22 | 10 | 7 | 64 | 42 | 22 |
| 2 | 福岡 | 38 | 66 | 19 | 9 | 10 | 58 | 33 | 25 |
| 3 | 鳥栖 | 38 | 66 | 18 | 12 | 8 | 49 | 37 | 12 |
| 4 | 熊本 | 39 | 61 | 17 | 10 | 12 | 46 | 47 | -1 |
| 5 | 東京V | 39 | 57 | 16 | 9 | 14 | 46 | 43 | 3 |
| 6 | 徳島 | 39 | 55 | 15 | 10 | 14 | 55 | 46 | 9 |
| 7 | 札幌 | 39 | 55 | 14 | 13 | 12 | 49 | 45 | 4 |
| 8 | 柏 | 23 | 52 | 15 | 7 | 1 | 43 | 15 | 28 |
| 9 | 横浜F | 38 | 51 | 15 | 6 | 17 | 51 | 51 | 0 |
| 10 | 岐阜 | 39 | 47 | 14 | 5 | 20 | 45 | 55 | -10 |
| 11 | 栃木 | 39 | 46 | 12 | 10 | 17 | 43 | 44 | -1 |
| 12 | 群馬 | 39 | 46 | 13 | 7 | 19 | 39 | 63 | -24 |
| 13 | 千葉 | 23 | 42 | 12 | 6 | 5 | 44 | 22 | 22 |
| 14 | 仙台 | 16 | 39 | 12 | 3 | 1 | 30 | 10 | 20 |
| 15 | 愛媛 | 39 | 38 | 8 | 14 | 17 | 32 | 45 | -13 |
| 16 | C大阪 | 16 | 36 | 11 | 3 | 2 | 29 | 10 | 19 |
| 17 | 水戸 | 38 | 36 | 9 | 9 | 20 | 32 | 61 | -29 |
| 18 | 湘南 | 16 | 31 | 9 | 4 | 3 | 22 | 14 | 8 |
| 19 | 富山 | 39 | 30 | 8 | 6 | 25 | 38 | 66 | -28 |
| 20 | 大分 | 23 | 26 | 7 | 5 | 11 | 29 | 37 | -8 |
| 21 | 岡山 | 38 | 24 | 6 | 6 | 26 | 23 | 61 | -38 |
| 22 | 北九州 | 23 | 13 | 1 | 10 | 12 | 15 | 35 | -20 |
