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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 甲府 | 49 | 94 | 27 | 13 | 9 | 78 | 53 | 25 |
| 2 | 福岡 | 48 | 82 | 23 | 13 | 12 | 72 | 50 | 22 |
| 3 | 鳥栖 | 48 | 82 | 22 | 16 | 10 | 66 | 48 | 18 |
| 4 | 札幌 | 49 | 72 | 19 | 15 | 15 | 66 | 58 | 8 |
| 5 | 東京V | 49 | 70 | 20 | 10 | 19 | 63 | 54 | 9 |
| 6 | 徳島 | 49 | 68 | 19 | 11 | 19 | 69 | 58 | 11 |
| 7 | 熊本 | 49 | 67 | 19 | 10 | 20 | 58 | 70 | -12 |
| 8 | 岐阜 | 49 | 65 | 19 | 8 | 22 | 59 | 68 | -9 |
| 9 | 横浜F | 48 | 59 | 17 | 8 | 23 | 59 | 67 | -8 |
| 10 | 水戸 | 48 | 59 | 16 | 11 | 21 | 51 | 66 | -15 |
| 11 | 仙台 | 26 | 56 | 17 | 5 | 4 | 46 | 22 | 24 |
| 12 | 群馬 | 49 | 55 | 15 | 10 | 24 | 48 | 75 | -27 |
| 13 | 柏 | 23 | 52 | 15 | 7 | 1 | 43 | 15 | 28 |
| 14 | C大阪 | 26 | 51 | 15 | 6 | 5 | 49 | 24 | 25 |
| 15 | 栃木 | 49 | 51 | 13 | 12 | 24 | 49 | 62 | -13 |
| 16 | 富山 | 49 | 51 | 14 | 9 | 26 | 53 | 75 | -22 |
| 17 | 愛媛 | 49 | 45 | 10 | 15 | 24 | 40 | 66 | -26 |
| 18 | 湘南 | 26 | 44 | 13 | 5 | 8 | 35 | 29 | 6 |
| 19 | 千葉 | 23 | 42 | 12 | 6 | 5 | 44 | 22 | 22 |
| 20 | 岡山 | 48 | 39 | 10 | 9 | 29 | 35 | 73 | -38 |
| 21 | 大分 | 23 | 26 | 7 | 5 | 11 | 29 | 37 | -8 |
| 22 | 北九州 | 23 | 13 | 1 | 10 | 12 | 15 | 35 | -20 |
