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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 甲府 | 40 | 78 | 23 | 9 | 8 | 61 | 40 | 21 |
| 2 | 鳥栖 | 40 | 67 | 18 | 13 | 9 | 51 | 40 | 11 |
| 3 | 福岡 | 39 | 64 | 18 | 10 | 11 | 55 | 37 | 18 |
| 4 | 札幌 | 40 | 64 | 17 | 13 | 10 | 57 | 45 | 12 |
| 5 | 熊本 | 40 | 58 | 16 | 10 | 14 | 45 | 50 | -5 |
| 6 | 東京V | 40 | 52 | 14 | 10 | 16 | 43 | 45 | -2 |
| 7 | 徳島 | 40 | 51 | 14 | 9 | 17 | 49 | 44 | 5 |
| 8 | 横浜F | 40 | 51 | 15 | 6 | 19 | 52 | 56 | -4 |
| 9 | 群馬 | 40 | 47 | 13 | 8 | 19 | 40 | 61 | -21 |
| 10 | 仙台 | 20 | 46 | 14 | 4 | 2 | 35 | 13 | 22 |
| 11 | 栃木 | 40 | 46 | 12 | 10 | 18 | 44 | 48 | -4 |
| 12 | 岐阜 | 40 | 46 | 13 | 7 | 20 | 48 | 59 | -11 |
| 13 | 柏 | 20 | 45 | 13 | 6 | 1 | 36 | 13 | 23 |
| 14 | 水戸 | 39 | 42 | 11 | 9 | 19 | 36 | 57 | -21 |
| 15 | C大阪 | 20 | 41 | 12 | 5 | 3 | 34 | 15 | 19 |
| 16 | 愛媛 | 40 | 40 | 9 | 13 | 18 | 35 | 48 | -13 |
| 17 | 湘南 | 20 | 38 | 11 | 5 | 4 | 25 | 17 | 8 |
| 18 | 富山 | 40 | 37 | 10 | 7 | 23 | 39 | 63 | -24 |
| 19 | 千葉 | 20 | 36 | 10 | 6 | 4 | 38 | 21 | 17 |
| 20 | 岡山 | 40 | 34 | 9 | 7 | 24 | 30 | 59 | -29 |
| 21 | 大分 | 20 | 22 | 6 | 4 | 10 | 25 | 32 | -7 |
| 22 | 北九州 | 20 | 12 | 1 | 9 | 10 | 10 | 25 | -15 |
