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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 甲府 | 48 | 92 | 27 | 11 | 10 | 73 | 49 | 24 |
| 2 | 鳥栖 | 48 | 86 | 24 | 14 | 10 | 70 | 49 | 21 |
| 3 | 福岡 | 47 | 75 | 21 | 12 | 14 | 65 | 52 | 13 |
| 4 | 札幌 | 48 | 72 | 19 | 15 | 14 | 65 | 56 | 9 |
| 5 | 東京V | 48 | 70 | 20 | 10 | 18 | 61 | 51 | 10 |
| 6 | 熊本 | 48 | 67 | 19 | 10 | 19 | 61 | 69 | -8 |
| 7 | 徳島 | 48 | 65 | 18 | 11 | 19 | 62 | 54 | 8 |
| 8 | 水戸 | 47 | 61 | 17 | 10 | 20 | 53 | 62 | -9 |
| 9 | 岐阜 | 48 | 60 | 17 | 9 | 22 | 58 | 70 | -12 |
| 10 | 仙台 | 28 | 58 | 17 | 7 | 4 | 47 | 23 | 24 |
| 11 | 群馬 | 48 | 56 | 15 | 11 | 22 | 48 | 70 | -22 |
| 12 | C大阪 | 28 | 55 | 16 | 7 | 5 | 52 | 26 | 26 |
| 13 | 横浜F | 48 | 55 | 16 | 7 | 25 | 55 | 70 | -15 |
| 14 | 富山 | 48 | 51 | 14 | 9 | 25 | 50 | 71 | -21 |
| 15 | 栃木 | 48 | 49 | 12 | 13 | 23 | 48 | 62 | -14 |
| 16 | 湘南 | 28 | 48 | 14 | 6 | 8 | 38 | 30 | 8 |
| 17 | 柏 | 20 | 45 | 13 | 6 | 1 | 36 | 13 | 23 |
| 18 | 岡山 | 48 | 42 | 11 | 9 | 28 | 38 | 71 | -33 |
| 19 | 愛媛 | 48 | 41 | 9 | 14 | 25 | 40 | 67 | -27 |
| 20 | 千葉 | 20 | 36 | 10 | 6 | 4 | 38 | 21 | 17 |
| 21 | 大分 | 20 | 22 | 6 | 4 | 10 | 25 | 32 | -7 |
| 22 | 北九州 | 20 | 12 | 1 | 9 | 10 | 10 | 25 | -15 |
