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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 甲府 | 54 | 106 | 31 | 13 | 10 | 90 | 52 | 38 |
| 2 | 鳥栖 | 54 | 98 | 28 | 14 | 12 | 80 | 54 | 26 |
| 3 | 福岡 | 53 | 78 | 22 | 12 | 19 | 67 | 68 | -1 |
| 4 | 東京V | 54 | 77 | 21 | 14 | 19 | 70 | 60 | 10 |
| 5 | 徳島 | 54 | 76 | 21 | 13 | 20 | 72 | 63 | 9 |
| 6 | 札幌 | 54 | 76 | 19 | 19 | 16 | 70 | 64 | 6 |
| 7 | 仙台 | 35 | 74 | 22 | 8 | 5 | 61 | 28 | 33 |
| 8 | 熊本 | 54 | 72 | 20 | 12 | 22 | 69 | 80 | -11 |
| 9 | 水戸 | 54 | 72 | 20 | 12 | 22 | 60 | 72 | -12 |
| 10 | 岐阜 | 54 | 71 | 20 | 11 | 23 | 65 | 74 | -9 |
| 11 | C大阪 | 35 | 66 | 19 | 9 | 7 | 68 | 38 | 30 |
| 12 | 群馬 | 54 | 65 | 17 | 14 | 23 | 58 | 75 | -17 |
| 13 | 湘南 | 35 | 62 | 18 | 8 | 9 | 57 | 41 | 16 |
| 14 | 横浜F | 54 | 60 | 17 | 9 | 28 | 60 | 77 | -17 |
| 15 | 富山 | 54 | 57 | 15 | 12 | 27 | 54 | 82 | -28 |
| 16 | 栃木 | 54 | 52 | 13 | 13 | 28 | 52 | 75 | -23 |
| 17 | 愛媛 | 54 | 48 | 11 | 15 | 28 | 51 | 81 | -30 |
| 18 | 柏 | 19 | 45 | 13 | 6 | 0 | 36 | 12 | 24 |
| 19 | 岡山 | 54 | 43 | 11 | 10 | 33 | 38 | 78 | -40 |
| 20 | 千葉 | 19 | 35 | 10 | 5 | 4 | 37 | 20 | 17 |
| 21 | 大分 | 19 | 19 | 5 | 4 | 10 | 24 | 32 | -8 |
| 22 | 北九州 | 19 | 12 | 1 | 9 | 9 | 10 | 23 | -13 |
