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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 甲府 | 43 | 85 | 25 | 10 | 8 | 66 | 42 | 24 |
| 2 | 鳥栖 | 43 | 77 | 22 | 11 | 10 | 62 | 44 | 18 |
| 3 | 福岡 | 43 | 71 | 20 | 11 | 12 | 61 | 47 | 14 |
| 4 | 札幌 | 43 | 68 | 18 | 14 | 11 | 61 | 51 | 10 |
| 5 | 徳島 | 43 | 59 | 17 | 8 | 18 | 57 | 49 | 8 |
| 6 | 東京V | 43 | 57 | 16 | 9 | 18 | 54 | 49 | 5 |
| 7 | 岐阜 | 43 | 57 | 17 | 6 | 20 | 52 | 60 | -8 |
| 8 | 熊本 | 43 | 57 | 16 | 9 | 18 | 50 | 63 | -13 |
| 9 | 仙台 | 26 | 56 | 17 | 5 | 4 | 46 | 22 | 24 |
| 10 | 水戸 | 43 | 54 | 15 | 9 | 19 | 47 | 57 | -10 |
| 11 | C大阪 | 26 | 51 | 15 | 6 | 5 | 49 | 24 | 25 |
| 12 | 横浜F | 43 | 49 | 14 | 7 | 22 | 50 | 63 | -13 |
| 13 | 富山 | 43 | 47 | 13 | 8 | 22 | 46 | 64 | -18 |
| 14 | 群馬 | 43 | 45 | 12 | 9 | 22 | 42 | 68 | -26 |
| 15 | 湘南 | 26 | 44 | 13 | 5 | 8 | 35 | 29 | 6 |
| 16 | 栃木 | 43 | 44 | 11 | 11 | 21 | 40 | 53 | -13 |
| 17 | 柏 | 17 | 43 | 13 | 4 | 0 | 33 | 9 | 24 |
| 18 | 愛媛 | 43 | 39 | 9 | 12 | 22 | 36 | 58 | -22 |
| 19 | 岡山 | 43 | 35 | 9 | 8 | 26 | 33 | 65 | -32 |
| 20 | 千葉 | 17 | 31 | 9 | 4 | 4 | 30 | 18 | 12 |
| 21 | 大分 | 17 | 19 | 5 | 4 | 8 | 23 | 25 | -2 |
| 22 | 北九州 | 18 | 11 | 1 | 8 | 9 | 9 | 22 | -13 |
