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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 甲府 | 44 | 83 | 24 | 11 | 9 | 67 | 45 | 22 |
| 1 | 鳥栖 | 44 | 83 | 24 | 11 | 9 | 67 | 45 | 22 |
| 3 | 福岡 | 44 | 71 | 20 | 11 | 13 | 62 | 50 | 12 |
| 4 | 札幌 | 44 | 66 | 17 | 15 | 12 | 59 | 53 | 6 |
| 5 | 熊本 | 44 | 62 | 18 | 8 | 18 | 56 | 65 | -9 |
| 6 | 徳島 | 44 | 60 | 17 | 9 | 18 | 58 | 50 | 8 |
| 7 | 東京V | 44 | 60 | 17 | 9 | 18 | 57 | 50 | 7 |
| 8 | 仙台 | 28 | 58 | 17 | 7 | 4 | 47 | 23 | 24 |
| 9 | 岐阜 | 45 | 58 | 17 | 7 | 21 | 54 | 65 | -11 |
| 10 | 水戸 | 44 | 57 | 16 | 9 | 19 | 49 | 58 | -9 |
| 11 | C大阪 | 28 | 55 | 16 | 7 | 5 | 52 | 26 | 26 |
| 12 | 湘南 | 28 | 48 | 14 | 6 | 8 | 38 | 30 | 8 |
| 13 | 横浜F | 44 | 48 | 14 | 6 | 24 | 48 | 65 | -17 |
| 14 | 栃木 | 44 | 46 | 11 | 13 | 20 | 42 | 54 | -12 |
| 15 | 群馬 | 44 | 46 | 12 | 10 | 22 | 43 | 68 | -25 |
| 16 | 富山 | 44 | 45 | 12 | 9 | 23 | 45 | 65 | -20 |
| 17 | 柏 | 16 | 42 | 13 | 3 | 0 | 31 | 7 | 24 |
| 18 | 愛媛 | 44 | 39 | 9 | 12 | 23 | 37 | 61 | -24 |
| 19 | 岡山 | 44 | 35 | 9 | 8 | 27 | 35 | 68 | -33 |
| 20 | 千葉 | 16 | 31 | 9 | 4 | 3 | 30 | 15 | 15 |
| 21 | 大分 | 16 | 19 | 5 | 4 | 7 | 23 | 24 | -1 |
| 22 | 北九州 | 17 | 10 | 1 | 7 | 9 | 7 | 20 | -13 |
