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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 甲府 | 46 | 87 | 25 | 12 | 9 | 74 | 46 | 28 |
| 2 | 鳥栖 | 46 | 87 | 25 | 12 | 9 | 69 | 45 | 24 |
| 3 | 福岡 | 46 | 71 | 20 | 11 | 15 | 62 | 59 | 3 |
| 4 | 札幌 | 46 | 67 | 17 | 16 | 13 | 62 | 57 | 5 |
| 5 | 熊本 | 46 | 66 | 19 | 9 | 18 | 59 | 66 | -7 |
| 6 | 東京V | 46 | 64 | 18 | 10 | 18 | 61 | 53 | 8 |
| 7 | 徳島 | 46 | 63 | 18 | 9 | 19 | 60 | 53 | 7 |
| 8 | 水戸 | 46 | 63 | 18 | 9 | 19 | 52 | 59 | -7 |
| 9 | 仙台 | 30 | 62 | 18 | 8 | 4 | 51 | 26 | 25 |
| 10 | 岐阜 | 47 | 62 | 18 | 8 | 21 | 57 | 65 | -8 |
| 11 | C大阪 | 30 | 58 | 17 | 7 | 6 | 56 | 30 | 26 |
| 12 | 湘南 | 30 | 51 | 15 | 6 | 9 | 42 | 34 | 8 |
| 13 | 横浜F | 46 | 49 | 14 | 7 | 25 | 49 | 68 | -19 |
| 14 | 富山 | 46 | 47 | 12 | 11 | 23 | 46 | 66 | -20 |
| 15 | 群馬 | 46 | 47 | 12 | 11 | 23 | 45 | 71 | -26 |
| 16 | 栃木 | 46 | 46 | 11 | 13 | 22 | 43 | 58 | -15 |
| 17 | 柏 | 16 | 42 | 13 | 3 | 0 | 31 | 7 | 24 |
| 18 | 愛媛 | 46 | 42 | 10 | 12 | 24 | 42 | 65 | -23 |
| 19 | 岡山 | 46 | 36 | 9 | 9 | 28 | 35 | 69 | -34 |
| 20 | 千葉 | 16 | 31 | 9 | 4 | 3 | 30 | 15 | 15 |
| 21 | 大分 | 16 | 19 | 5 | 4 | 7 | 23 | 24 | -1 |
| 22 | 北九州 | 17 | 10 | 1 | 7 | 9 | 7 | 20 | -13 |
