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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 甲府 | 50 | 97 | 28 | 13 | 9 | 82 | 47 | 35 |
| 2 | 鳥栖 | 50 | 96 | 28 | 12 | 10 | 78 | 49 | 29 |
| 3 | 福岡 | 50 | 77 | 22 | 11 | 17 | 65 | 62 | 3 |
| 4 | 札幌 | 50 | 72 | 18 | 18 | 14 | 65 | 60 | 5 |
| 5 | 仙台 | 34 | 71 | 21 | 8 | 5 | 59 | 27 | 32 |
| 6 | 徳島 | 50 | 71 | 20 | 11 | 19 | 67 | 57 | 10 |
| 7 | 東京V | 50 | 69 | 19 | 12 | 19 | 66 | 58 | 8 |
| 8 | 熊本 | 50 | 68 | 19 | 11 | 20 | 65 | 76 | -11 |
| 9 | 岐阜 | 51 | 67 | 19 | 10 | 22 | 61 | 70 | -9 |
| 10 | 水戸 | 50 | 65 | 18 | 11 | 21 | 53 | 66 | -13 |
| 11 | C大阪 | 34 | 63 | 18 | 9 | 7 | 64 | 37 | 27 |
| 12 | 湘南 | 34 | 59 | 17 | 8 | 9 | 52 | 41 | 11 |
| 13 | 横浜F | 50 | 56 | 16 | 8 | 26 | 54 | 70 | -16 |
| 14 | 群馬 | 50 | 55 | 14 | 13 | 23 | 52 | 74 | -22 |
| 15 | 富山 | 50 | 51 | 13 | 12 | 25 | 49 | 72 | -23 |
| 16 | 栃木 | 50 | 49 | 12 | 13 | 25 | 45 | 66 | -21 |
| 17 | 愛媛 | 50 | 43 | 10 | 13 | 27 | 46 | 77 | -31 |
| 18 | 柏 | 16 | 42 | 13 | 3 | 0 | 31 | 7 | 24 |
| 19 | 岡山 | 50 | 36 | 9 | 9 | 32 | 35 | 74 | -39 |
| 20 | 千葉 | 16 | 31 | 9 | 4 | 3 | 30 | 15 | 15 |
| 21 | 大分 | 16 | 19 | 5 | 4 | 7 | 23 | 24 | -1 |
| 22 | 北九州 | 17 | 10 | 1 | 7 | 9 | 7 | 20 | -13 |
