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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 甲府 | 68 | 132 | 38 | 18 | 12 | 106 | 62 | 44 |
| 2 | 鳥栖 | 68 | 116 | 33 | 17 | 18 | 94 | 72 | 22 |
| 3 | 仙台 | 52 | 109 | 33 | 10 | 9 | 88 | 39 | 49 |
| 4 | C大阪 | 52 | 107 | 32 | 11 | 9 | 102 | 54 | 48 |
| 5 | 札幌 | 67 | 99 | 25 | 24 | 18 | 90 | 81 | 9 |
| 6 | 湘南 | 52 | 98 | 29 | 11 | 12 | 85 | 55 | 30 |
| 7 | 福岡 | 68 | 97 | 27 | 16 | 25 | 83 | 86 | -3 |
| 8 | 徳島 | 68 | 95 | 26 | 17 | 25 | 89 | 79 | 10 |
| 9 | 東京V | 67 | 94 | 26 | 16 | 25 | 84 | 75 | 9 |
| 10 | 水戸 | 68 | 93 | 26 | 15 | 27 | 82 | 96 | -14 |
| 11 | 岐阜 | 69 | 86 | 24 | 14 | 31 | 76 | 95 | -19 |
| 12 | 熊本 | 67 | 84 | 23 | 15 | 29 | 81 | 100 | -19 |
| 13 | 群馬 | 68 | 75 | 20 | 15 | 33 | 77 | 104 | -27 |
| 14 | 富山 | 67 | 74 | 19 | 17 | 31 | 65 | 89 | -24 |
| 15 | 愛媛 | 68 | 67 | 17 | 16 | 35 | 68 | 96 | -28 |
| 16 | 横浜F | 68 | 64 | 17 | 13 | 38 | 66 | 95 | -29 |
| 17 | 栃木 | 67 | 63 | 15 | 18 | 34 | 59 | 90 | -31 |
| 18 | 岡山 | 67 | 48 | 11 | 15 | 41 | 47 | 103 | -56 |
| 19 | 柏 | 16 | 42 | 13 | 3 | 0 | 31 | 7 | 24 |
| 20 | 千葉 | 16 | 31 | 9 | 4 | 3 | 30 | 15 | 15 |
| 21 | 大分 | 16 | 19 | 5 | 4 | 7 | 23 | 24 | -1 |
| 22 | 北九州 | 17 | 10 | 1 | 7 | 9 | 7 | 20 | -13 |
| 23 | 広島 | 1 | 3 | 1 | 0 | 0 | 3 | 0 | 3 |
| 24 | 山形 | 1 | 3 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 1 |
