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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 甲府 | 70 | 135 | 39 | 18 | 13 | 108 | 64 | 44 |
| 2 | 鳥栖 | 70 | 119 | 34 | 17 | 19 | 98 | 75 | 23 |
| 3 | C大阪 | 54 | 113 | 34 | 11 | 9 | 108 | 55 | 53 |
| 4 | 仙台 | 54 | 110 | 33 | 11 | 10 | 91 | 45 | 46 |
| 5 | 湘南 | 54 | 101 | 30 | 11 | 13 | 89 | 57 | 32 |
| 6 | 福岡 | 70 | 101 | 28 | 17 | 25 | 86 | 88 | -2 |
| 7 | 札幌 | 67 | 99 | 25 | 24 | 18 | 90 | 81 | 9 |
| 8 | 徳島 | 69 | 98 | 27 | 17 | 25 | 91 | 79 | 12 |
| 9 | 東京V | 67 | 94 | 26 | 16 | 25 | 84 | 75 | 9 |
| 10 | 水戸 | 70 | 93 | 26 | 15 | 29 | 85 | 101 | -16 |
| 11 | 岐阜 | 70 | 86 | 24 | 14 | 32 | 76 | 98 | -22 |
| 12 | 熊本 | 69 | 85 | 23 | 16 | 30 | 83 | 103 | -20 |
| 13 | 群馬 | 70 | 75 | 20 | 15 | 35 | 80 | 112 | -32 |
| 14 | 富山 | 67 | 74 | 19 | 17 | 31 | 65 | 89 | -24 |
| 15 | 横浜F | 70 | 68 | 18 | 14 | 38 | 71 | 99 | -28 |
| 16 | 愛媛 | 70 | 68 | 17 | 17 | 36 | 72 | 101 | -29 |
| 17 | 栃木 | 67 | 63 | 15 | 18 | 34 | 59 | 90 | -31 |
| 18 | 岡山 | 67 | 48 | 11 | 15 | 41 | 47 | 103 | -56 |
| 19 | 柏 | 16 | 42 | 13 | 3 | 0 | 31 | 7 | 24 |
| 20 | 千葉 | 16 | 31 | 9 | 4 | 3 | 30 | 15 | 15 |
| 21 | 大分 | 16 | 19 | 5 | 4 | 7 | 23 | 24 | -1 |
| 22 | 北九州 | 17 | 10 | 1 | 7 | 9 | 7 | 20 | -13 |
| 23 | 広島 | 3 | 9 | 3 | 0 | 0 | 9 | 4 | 5 |
| 24 | 山形 | 3 | 7 | 2 | 1 | 0 | 5 | 3 | 2 |
