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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 甲府 | 36 | 71 | 21 | 8 | 7 | 55 | 34 | 21 |
| 2 | 鳥栖 | 36 | 64 | 18 | 10 | 8 | 48 | 36 | 12 |
| 3 | 福岡 | 36 | 58 | 16 | 10 | 10 | 50 | 34 | 16 |
| 4 | 札幌 | 36 | 57 | 15 | 12 | 9 | 49 | 43 | 6 |
| 5 | 熊本 | 36 | 50 | 14 | 8 | 14 | 40 | 48 | -8 |
| 6 | 仙台 | 21 | 49 | 15 | 4 | 2 | 38 | 15 | 23 |
| 7 | 徳島 | 36 | 49 | 14 | 7 | 15 | 50 | 38 | 12 |
| 8 | C大阪 | 21 | 44 | 13 | 5 | 3 | 37 | 15 | 22 |
| 9 | 横浜F | 37 | 44 | 13 | 5 | 19 | 45 | 53 | -8 |
| 10 | 栃木 | 36 | 43 | 11 | 10 | 15 | 38 | 40 | -2 |
| 11 | 東京V | 36 | 42 | 11 | 9 | 16 | 41 | 44 | -3 |
| 12 | 岐阜 | 37 | 41 | 12 | 5 | 20 | 43 | 57 | -14 |
| 13 | 水戸 | 36 | 40 | 11 | 7 | 18 | 34 | 53 | -19 |
| 14 | 柏 | 15 | 39 | 12 | 3 | 0 | 29 | 7 | 22 |
| 15 | 湘南 | 21 | 38 | 11 | 5 | 5 | 25 | 18 | 7 |
| 16 | 愛媛 | 36 | 37 | 9 | 10 | 17 | 30 | 46 | -16 |
| 17 | 群馬 | 36 | 36 | 10 | 6 | 20 | 35 | 61 | -26 |
| 18 | 富山 | 36 | 34 | 9 | 7 | 20 | 35 | 56 | -21 |
| 19 | 千葉 | 15 | 30 | 9 | 3 | 3 | 28 | 13 | 15 |
| 20 | 岡山 | 36 | 28 | 7 | 7 | 22 | 27 | 55 | -28 |
| 21 | 大分 | 15 | 19 | 5 | 4 | 6 | 22 | 22 | 0 |
| 22 | 北九州 | 16 | 10 | 1 | 7 | 8 | 7 | 18 | -11 |
