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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 甲府 | 65 | 129 | 38 | 15 | 12 | 104 | 60 | 44 |
| 2 | 鳥栖 | 65 | 113 | 32 | 17 | 16 | 90 | 66 | 24 |
| 3 | 仙台 | 50 | 103 | 31 | 10 | 9 | 86 | 39 | 47 |
| 4 | C大阪 | 50 | 101 | 30 | 11 | 9 | 96 | 52 | 44 |
| 5 | 札幌 | 65 | 98 | 25 | 23 | 17 | 88 | 78 | 10 |
| 6 | 湘南 | 50 | 95 | 28 | 11 | 11 | 82 | 51 | 31 |
| 7 | 徳島 | 65 | 94 | 26 | 16 | 23 | 88 | 74 | 14 |
| 8 | 水戸 | 65 | 92 | 26 | 14 | 25 | 80 | 91 | -11 |
| 9 | 東京V | 65 | 90 | 25 | 15 | 25 | 83 | 75 | 8 |
| 10 | 福岡 | 65 | 90 | 25 | 15 | 25 | 78 | 84 | -6 |
| 11 | 熊本 | 65 | 81 | 22 | 15 | 28 | 78 | 97 | -19 |
| 12 | 岐阜 | 66 | 77 | 21 | 14 | 31 | 73 | 95 | -22 |
| 13 | 富山 | 65 | 73 | 19 | 16 | 30 | 65 | 88 | -23 |
| 14 | 群馬 | 65 | 71 | 19 | 14 | 32 | 74 | 101 | -27 |
| 15 | 横浜F | 66 | 63 | 17 | 12 | 37 | 65 | 93 | -28 |
| 16 | 栃木 | 65 | 63 | 15 | 18 | 32 | 58 | 86 | -28 |
| 17 | 愛媛 | 65 | 63 | 16 | 15 | 34 | 62 | 91 | -29 |
| 18 | 岡山 | 65 | 47 | 11 | 14 | 40 | 47 | 102 | -55 |
| 19 | 柏 | 15 | 39 | 12 | 3 | 0 | 29 | 7 | 22 |
| 20 | 千葉 | 15 | 30 | 9 | 3 | 3 | 28 | 13 | 15 |
| 21 | 大分 | 15 | 19 | 5 | 4 | 6 | 22 | 22 | 0 |
| 22 | 北九州 | 16 | 10 | 1 | 7 | 8 | 7 | 18 | -11 |
