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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 甲府 | 48 | 95 | 28 | 11 | 9 | 80 | 45 | 35 |
| 2 | 鳥栖 | 48 | 90 | 26 | 12 | 10 | 73 | 47 | 26 |
| 3 | 福岡 | 48 | 74 | 21 | 11 | 16 | 63 | 60 | 3 |
| 4 | 徳島 | 48 | 70 | 20 | 10 | 18 | 64 | 53 | 11 |
| 5 | 札幌 | 48 | 70 | 18 | 16 | 14 | 63 | 58 | 5 |
| 6 | 仙台 | 33 | 68 | 20 | 8 | 5 | 54 | 27 | 27 |
| 7 | 東京V | 48 | 66 | 18 | 12 | 18 | 65 | 55 | 10 |
| 8 | 熊本 | 48 | 65 | 18 | 11 | 19 | 62 | 73 | -11 |
| 9 | 水戸 | 48 | 64 | 18 | 10 | 20 | 52 | 60 | -8 |
| 10 | C大阪 | 33 | 62 | 18 | 8 | 7 | 62 | 35 | 27 |
| 11 | 岐阜 | 49 | 61 | 17 | 10 | 22 | 59 | 70 | -11 |
| 12 | 湘南 | 33 | 56 | 16 | 8 | 9 | 51 | 41 | 10 |
| 13 | 横浜F | 49 | 53 | 15 | 8 | 26 | 51 | 70 | -19 |
| 14 | 富山 | 48 | 51 | 13 | 12 | 23 | 49 | 70 | -21 |
| 15 | 群馬 | 48 | 51 | 13 | 12 | 23 | 48 | 73 | -25 |
| 16 | 栃木 | 48 | 46 | 11 | 13 | 24 | 43 | 63 | -20 |
| 17 | 愛媛 | 48 | 42 | 10 | 12 | 26 | 44 | 72 | -28 |
| 18 | 柏 | 15 | 39 | 12 | 3 | 0 | 29 | 7 | 22 |
| 19 | 岡山 | 48 | 36 | 9 | 9 | 30 | 35 | 72 | -37 |
| 20 | 千葉 | 15 | 30 | 9 | 3 | 3 | 28 | 13 | 15 |
| 21 | 大分 | 15 | 19 | 5 | 4 | 6 | 22 | 22 | 0 |
| 22 | 北九州 | 16 | 10 | 1 | 7 | 8 | 7 | 18 | -11 |
