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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 甲府 | 29 | 59 | 18 | 5 | 6 | 48 | 29 | 19 |
| 2 | 鳥栖 | 29 | 55 | 16 | 7 | 6 | 38 | 28 | 10 |
| 3 | 福岡 | 29 | 49 | 14 | 7 | 8 | 42 | 25 | 17 |
| 4 | 熊本 | 30 | 47 | 13 | 8 | 9 | 34 | 35 | -1 |
| 5 | 札幌 | 29 | 43 | 11 | 10 | 8 | 33 | 33 | 0 |
| 6 | 徳島 | 29 | 40 | 11 | 7 | 11 | 37 | 32 | 5 |
| 7 | 栃木 | 29 | 39 | 10 | 9 | 10 | 32 | 27 | 5 |
| 8 | 東京V | 29 | 37 | 10 | 7 | 12 | 33 | 34 | -1 |
| 9 | 柏 | 14 | 36 | 11 | 3 | 0 | 27 | 7 | 20 |
| 10 | 仙台 | 15 | 36 | 11 | 3 | 1 | 28 | 9 | 19 |
| 11 | 岐阜 | 30 | 36 | 11 | 3 | 16 | 36 | 43 | -7 |
| 12 | 横浜F | 30 | 34 | 10 | 4 | 16 | 37 | 45 | -8 |
| 13 | C大阪 | 15 | 33 | 10 | 3 | 2 | 27 | 10 | 17 |
| 14 | 群馬 | 29 | 31 | 9 | 4 | 16 | 27 | 48 | -21 |
| 15 | 湘南 | 15 | 28 | 8 | 4 | 3 | 21 | 14 | 7 |
| 16 | 愛媛 | 29 | 28 | 6 | 10 | 13 | 22 | 29 | -7 |
| 17 | 千葉 | 14 | 27 | 8 | 3 | 3 | 25 | 13 | 12 |
| 18 | 水戸 | 29 | 27 | 7 | 6 | 16 | 21 | 44 | -23 |
| 19 | 富山 | 29 | 20 | 5 | 5 | 19 | 27 | 51 | -24 |
| 20 | 大分 | 14 | 18 | 5 | 3 | 6 | 21 | 21 | 0 |
| 21 | 岡山 | 29 | 17 | 4 | 5 | 20 | 17 | 45 | -28 |
| 22 | 北九州 | 15 | 9 | 1 | 6 | 8 | 7 | 18 | -11 |
