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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 甲府 | 39 | 80 | 24 | 8 | 7 | 62 | 38 | 24 |
| 2 | 鳥栖 | 39 | 73 | 21 | 10 | 8 | 56 | 38 | 18 |
| 3 | 福岡 | 39 | 65 | 18 | 11 | 10 | 56 | 38 | 18 |
| 4 | 札幌 | 39 | 60 | 16 | 12 | 11 | 53 | 47 | 6 |
| 5 | 仙台 | 25 | 55 | 17 | 4 | 4 | 45 | 21 | 24 |
| 6 | 岐阜 | 40 | 53 | 16 | 5 | 19 | 50 | 57 | -7 |
| 7 | 熊本 | 40 | 53 | 15 | 8 | 17 | 46 | 58 | -12 |
| 8 | 徳島 | 39 | 50 | 14 | 8 | 17 | 50 | 45 | 5 |
| 9 | 水戸 | 39 | 50 | 14 | 8 | 17 | 39 | 51 | -12 |
| 10 | C大阪 | 25 | 48 | 14 | 6 | 5 | 46 | 23 | 23 |
| 11 | 東京V | 39 | 47 | 13 | 8 | 18 | 49 | 48 | 1 |
| 12 | 横浜F | 40 | 45 | 13 | 6 | 21 | 46 | 59 | -13 |
| 13 | 栃木 | 39 | 44 | 11 | 11 | 17 | 37 | 44 | -7 |
| 14 | 湘南 | 25 | 41 | 12 | 5 | 8 | 33 | 28 | 5 |
| 15 | 群馬 | 39 | 39 | 11 | 6 | 22 | 37 | 64 | -27 |
| 16 | 愛媛 | 39 | 38 | 9 | 11 | 19 | 32 | 49 | -17 |
| 17 | 富山 | 39 | 38 | 10 | 8 | 21 | 40 | 61 | -21 |
| 18 | 柏 | 14 | 36 | 11 | 3 | 0 | 27 | 7 | 20 |
| 19 | 岡山 | 39 | 32 | 8 | 8 | 23 | 31 | 60 | -29 |
| 20 | 千葉 | 14 | 27 | 8 | 3 | 3 | 25 | 13 | 12 |
| 21 | 大分 | 14 | 18 | 5 | 3 | 6 | 21 | 21 | 0 |
| 22 | 北九州 | 15 | 9 | 1 | 6 | 8 | 7 | 18 | -11 |
