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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 甲府 | 48 | 95 | 28 | 11 | 9 | 80 | 45 | 35 |
| 2 | 鳥栖 | 48 | 93 | 27 | 12 | 9 | 74 | 46 | 28 |
| 3 | 仙台 | 34 | 71 | 21 | 8 | 5 | 59 | 27 | 32 |
| 4 | 福岡 | 48 | 71 | 20 | 11 | 17 | 61 | 60 | 1 |
| 5 | 札幌 | 48 | 70 | 18 | 16 | 14 | 62 | 57 | 5 |
| 6 | 徳島 | 48 | 68 | 19 | 11 | 18 | 63 | 54 | 9 |
| 7 | 東京V | 48 | 65 | 18 | 11 | 19 | 64 | 57 | 7 |
| 8 | 熊本 | 49 | 65 | 18 | 11 | 20 | 63 | 75 | -12 |
| 9 | 岐阜 | 49 | 64 | 18 | 10 | 21 | 60 | 68 | -8 |
| 10 | 水戸 | 48 | 64 | 18 | 10 | 20 | 51 | 62 | -11 |
| 11 | C大阪 | 34 | 63 | 18 | 9 | 7 | 64 | 37 | 27 |
| 12 | 湘南 | 34 | 59 | 17 | 8 | 9 | 52 | 41 | 11 |
| 13 | 横浜F | 49 | 53 | 15 | 8 | 26 | 52 | 70 | -18 |
| 14 | 群馬 | 48 | 53 | 14 | 11 | 23 | 50 | 72 | -22 |
| 15 | 栃木 | 48 | 49 | 12 | 13 | 23 | 43 | 61 | -18 |
| 16 | 富山 | 48 | 48 | 12 | 12 | 24 | 47 | 70 | -23 |
| 17 | 愛媛 | 48 | 42 | 10 | 12 | 26 | 44 | 72 | -28 |
| 18 | 柏 | 14 | 36 | 11 | 3 | 0 | 27 | 7 | 20 |
| 19 | 岡山 | 48 | 36 | 9 | 9 | 30 | 35 | 71 | -36 |
| 20 | 千葉 | 14 | 27 | 8 | 3 | 3 | 25 | 13 | 12 |
| 21 | 大分 | 14 | 18 | 5 | 3 | 6 | 21 | 21 | 0 |
| 22 | 北九州 | 15 | 9 | 1 | 6 | 8 | 7 | 18 | -11 |
