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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 甲府 | 68 | 133 | 39 | 16 | 13 | 106 | 62 | 44 |
| 2 | 鳥栖 | 68 | 116 | 33 | 17 | 18 | 94 | 72 | 22 |
| 3 | C大阪 | 54 | 113 | 34 | 11 | 9 | 108 | 55 | 53 |
| 4 | 仙台 | 54 | 110 | 33 | 11 | 10 | 91 | 45 | 46 |
| 5 | 湘南 | 54 | 101 | 30 | 11 | 13 | 89 | 57 | 32 |
| 6 | 札幌 | 65 | 97 | 25 | 22 | 18 | 87 | 78 | 9 |
| 7 | 徳島 | 67 | 95 | 26 | 17 | 24 | 87 | 76 | 11 |
| 8 | 福岡 | 68 | 95 | 26 | 17 | 25 | 82 | 86 | -4 |
| 9 | 水戸 | 68 | 92 | 26 | 14 | 28 | 83 | 97 | -14 |
| 10 | 東京V | 65 | 90 | 25 | 15 | 25 | 82 | 74 | 8 |
| 11 | 岐阜 | 68 | 83 | 23 | 14 | 31 | 75 | 96 | -21 |
| 12 | 熊本 | 68 | 82 | 22 | 16 | 30 | 81 | 102 | -21 |
| 13 | 群馬 | 68 | 73 | 20 | 13 | 35 | 78 | 110 | -32 |
| 14 | 富山 | 65 | 71 | 18 | 17 | 30 | 63 | 87 | -24 |
| 15 | 愛媛 | 68 | 67 | 17 | 16 | 35 | 70 | 96 | -26 |
| 16 | 横浜F | 69 | 65 | 17 | 14 | 38 | 69 | 99 | -30 |
| 17 | 栃木 | 65 | 63 | 15 | 18 | 32 | 57 | 85 | -28 |
| 18 | 岡山 | 65 | 48 | 11 | 15 | 39 | 47 | 100 | -53 |
| 19 | 柏 | 14 | 36 | 11 | 3 | 0 | 27 | 7 | 20 |
| 20 | 千葉 | 14 | 27 | 8 | 3 | 3 | 25 | 13 | 12 |
| 21 | 大分 | 14 | 18 | 5 | 3 | 6 | 21 | 21 | 0 |
| 22 | 広島 | 3 | 9 | 3 | 0 | 0 | 9 | 4 | 5 |
| 23 | 北九州 | 15 | 9 | 1 | 6 | 8 | 7 | 18 | -11 |
| 24 | 山形 | 3 | 7 | 2 | 1 | 0 | 5 | 3 | 2 |
