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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 甲府 | 37 | 74 | 22 | 8 | 7 | 58 | 36 | 22 |
| 2 | 鳥栖 | 37 | 67 | 19 | 10 | 8 | 50 | 36 | 14 |
| 3 | 福岡 | 37 | 59 | 16 | 11 | 10 | 54 | 38 | 16 |
| 4 | 札幌 | 37 | 57 | 15 | 12 | 10 | 50 | 45 | 5 |
| 5 | 仙台 | 24 | 52 | 16 | 4 | 4 | 42 | 20 | 22 |
| 6 | 徳島 | 37 | 50 | 14 | 8 | 15 | 50 | 40 | 10 |
| 7 | 岐阜 | 38 | 50 | 15 | 5 | 18 | 48 | 54 | -6 |
| 8 | 熊本 | 38 | 49 | 14 | 7 | 17 | 45 | 58 | -13 |
| 9 | C大阪 | 24 | 48 | 14 | 6 | 4 | 43 | 19 | 24 |
| 10 | 水戸 | 37 | 46 | 13 | 7 | 17 | 38 | 51 | -13 |
| 11 | 東京V | 37 | 43 | 12 | 7 | 18 | 44 | 47 | -3 |
| 12 | 横浜F | 38 | 43 | 13 | 4 | 21 | 45 | 58 | -13 |
| 13 | 栃木 | 37 | 41 | 10 | 11 | 16 | 35 | 43 | -8 |
| 14 | 群馬 | 37 | 39 | 11 | 6 | 20 | 34 | 59 | -25 |
| 15 | 湘南 | 24 | 38 | 11 | 5 | 8 | 29 | 25 | 4 |
| 16 | 愛媛 | 37 | 38 | 9 | 11 | 17 | 30 | 45 | -15 |
| 17 | 富山 | 37 | 38 | 10 | 8 | 19 | 38 | 55 | -17 |
| 18 | 柏 | 13 | 33 | 10 | 3 | 0 | 24 | 5 | 19 |
| 19 | 岡山 | 38 | 32 | 8 | 8 | 22 | 31 | 57 | -26 |
| 20 | 千葉 | 13 | 27 | 8 | 3 | 2 | 25 | 12 | 13 |
| 21 | 大分 | 13 | 17 | 5 | 2 | 6 | 21 | 21 | 0 |
| 22 | 北九州 | 14 | 9 | 1 | 6 | 7 | 5 | 15 | -10 |
