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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 甲府 | 44 | 85 | 25 | 10 | 9 | 74 | 44 | 30 |
| 2 | 鳥栖 | 44 | 84 | 24 | 12 | 8 | 67 | 40 | 27 |
| 3 | 福岡 | 44 | 65 | 18 | 11 | 15 | 58 | 57 | 1 |
| 4 | 札幌 | 44 | 63 | 16 | 15 | 13 | 57 | 54 | 3 |
| 5 | 仙台 | 31 | 62 | 18 | 8 | 5 | 51 | 27 | 24 |
| 6 | 熊本 | 45 | 62 | 18 | 8 | 19 | 58 | 69 | -11 |
| 7 | 徳島 | 44 | 61 | 17 | 10 | 17 | 57 | 50 | 7 |
| 8 | 東京V | 44 | 60 | 17 | 9 | 18 | 58 | 51 | 7 |
| 9 | 岐阜 | 45 | 60 | 17 | 9 | 19 | 58 | 63 | -5 |
| 10 | 水戸 | 44 | 60 | 17 | 9 | 18 | 49 | 55 | -6 |
| 11 | C大阪 | 31 | 58 | 17 | 7 | 7 | 58 | 33 | 25 |
| 12 | 湘南 | 31 | 52 | 15 | 7 | 9 | 44 | 36 | 8 |
| 13 | 横浜F | 45 | 48 | 14 | 6 | 25 | 47 | 67 | -20 |
| 14 | 富山 | 44 | 47 | 12 | 11 | 21 | 46 | 63 | -17 |
| 15 | 群馬 | 44 | 46 | 12 | 10 | 22 | 43 | 68 | -25 |
| 16 | 栃木 | 44 | 43 | 10 | 13 | 21 | 39 | 58 | -19 |
| 17 | 愛媛 | 44 | 42 | 10 | 12 | 22 | 41 | 60 | -19 |
| 18 | 岡山 | 45 | 36 | 9 | 9 | 27 | 35 | 67 | -32 |
| 19 | 柏 | 13 | 33 | 10 | 3 | 0 | 24 | 5 | 19 |
| 20 | 千葉 | 13 | 27 | 8 | 3 | 2 | 25 | 12 | 13 |
| 21 | 大分 | 13 | 17 | 5 | 2 | 6 | 21 | 21 | 0 |
| 22 | 北九州 | 14 | 9 | 1 | 6 | 7 | 5 | 15 | -10 |
