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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 甲府 | 40 | 75 | 22 | 9 | 9 | 64 | 41 | 23 |
| 2 | 鳥栖 | 40 | 75 | 21 | 12 | 7 | 57 | 36 | 21 |
| 3 | 仙台 | 29 | 61 | 18 | 7 | 4 | 49 | 24 | 25 |
| 4 | 札幌 | 40 | 60 | 16 | 12 | 12 | 52 | 48 | 4 |
| 5 | C大阪 | 29 | 58 | 17 | 7 | 5 | 56 | 28 | 28 |
| 6 | 徳島 | 40 | 56 | 16 | 8 | 16 | 54 | 43 | 11 |
| 7 | 福岡 | 40 | 56 | 15 | 11 | 14 | 54 | 53 | 1 |
| 8 | 水戸 | 40 | 56 | 16 | 8 | 16 | 47 | 52 | -5 |
| 9 | 熊本 | 41 | 56 | 16 | 8 | 17 | 54 | 63 | -9 |
| 10 | 東京V | 40 | 55 | 16 | 7 | 17 | 54 | 47 | 7 |
| 11 | 岐阜 | 41 | 55 | 16 | 7 | 18 | 55 | 58 | -3 |
| 12 | 湘南 | 29 | 48 | 14 | 6 | 9 | 39 | 32 | 7 |
| 13 | 群馬 | 41 | 45 | 12 | 9 | 20 | 39 | 60 | -21 |
| 14 | 富山 | 40 | 43 | 11 | 10 | 19 | 41 | 57 | -16 |
| 15 | 横浜F | 41 | 42 | 12 | 6 | 23 | 41 | 63 | -22 |
| 16 | 栃木 | 40 | 37 | 8 | 13 | 19 | 36 | 51 | -15 |
| 17 | 岡山 | 41 | 35 | 9 | 8 | 24 | 35 | 64 | -29 |
| 18 | 愛媛 | 40 | 34 | 8 | 10 | 22 | 33 | 57 | -24 |
| 19 | 柏 | 11 | 27 | 8 | 3 | 0 | 16 | 4 | 12 |
| 20 | 千葉 | 12 | 24 | 7 | 3 | 2 | 23 | 11 | 12 |
| 21 | 大分 | 11 | 16 | 5 | 1 | 5 | 19 | 17 | 2 |
| 22 | 北九州 | 12 | 8 | 1 | 5 | 6 | 4 | 13 | -9 |
