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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 甲府 | 44 | 85 | 25 | 10 | 9 | 73 | 43 | 30 |
| 2 | 鳥栖 | 44 | 84 | 24 | 12 | 8 | 66 | 39 | 27 |
| 3 | 仙台 | 33 | 68 | 20 | 8 | 5 | 54 | 27 | 27 |
| 4 | 徳島 | 44 | 66 | 19 | 9 | 16 | 61 | 45 | 16 |
| 5 | 札幌 | 44 | 64 | 17 | 13 | 14 | 57 | 54 | 3 |
| 6 | C大阪 | 33 | 62 | 18 | 8 | 7 | 62 | 35 | 27 |
| 7 | 福岡 | 44 | 62 | 17 | 11 | 16 | 57 | 58 | -1 |
| 8 | 東京V | 44 | 61 | 17 | 10 | 17 | 61 | 51 | 10 |
| 9 | 水戸 | 44 | 61 | 17 | 10 | 17 | 50 | 55 | -5 |
| 10 | 熊本 | 45 | 61 | 17 | 10 | 18 | 61 | 71 | -10 |
| 11 | 岐阜 | 45 | 58 | 16 | 10 | 19 | 58 | 63 | -5 |
| 12 | 湘南 | 33 | 56 | 16 | 8 | 9 | 51 | 41 | 10 |
| 13 | 群馬 | 45 | 50 | 13 | 11 | 21 | 44 | 65 | -21 |
| 14 | 富山 | 44 | 48 | 12 | 12 | 20 | 45 | 63 | -18 |
| 15 | 横浜F | 45 | 46 | 13 | 7 | 25 | 43 | 67 | -24 |
| 16 | 愛媛 | 44 | 38 | 9 | 11 | 24 | 40 | 66 | -26 |
| 17 | 栃木 | 44 | 37 | 8 | 13 | 23 | 37 | 61 | -24 |
| 18 | 岡山 | 45 | 36 | 9 | 9 | 27 | 35 | 68 | -33 |
| 19 | 柏 | 11 | 27 | 8 | 3 | 0 | 16 | 4 | 12 |
| 20 | 千葉 | 12 | 24 | 7 | 3 | 2 | 23 | 11 | 12 |
| 21 | 大分 | 11 | 16 | 5 | 1 | 5 | 19 | 17 | 2 |
| 22 | 北九州 | 12 | 8 | 1 | 5 | 6 | 4 | 13 | -9 |
