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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 甲府 | 46 | 89 | 26 | 11 | 9 | 76 | 44 | 32 |
| 2 | 鳥栖 | 46 | 87 | 25 | 12 | 9 | 68 | 42 | 26 |
| 3 | 仙台 | 35 | 74 | 22 | 8 | 5 | 61 | 28 | 33 |
| 4 | 徳島 | 46 | 67 | 19 | 10 | 17 | 64 | 50 | 14 |
| 5 | C大阪 | 35 | 66 | 19 | 9 | 7 | 68 | 38 | 30 |
| 6 | 札幌 | 46 | 66 | 17 | 15 | 14 | 58 | 55 | 3 |
| 7 | 岐阜 | 47 | 64 | 18 | 10 | 19 | 60 | 63 | -3 |
| 8 | 水戸 | 46 | 64 | 18 | 10 | 18 | 53 | 62 | -9 |
| 9 | 湘南 | 35 | 62 | 18 | 8 | 9 | 57 | 41 | 16 |
| 10 | 東京V | 46 | 62 | 17 | 11 | 18 | 62 | 55 | 7 |
| 11 | 福岡 | 46 | 62 | 17 | 11 | 18 | 58 | 63 | -5 |
| 12 | 熊本 | 47 | 61 | 17 | 10 | 20 | 62 | 74 | -12 |
| 13 | 群馬 | 47 | 56 | 15 | 11 | 21 | 50 | 65 | -15 |
| 14 | 横浜F | 47 | 49 | 14 | 7 | 26 | 47 | 69 | -22 |
| 15 | 富山 | 46 | 48 | 12 | 12 | 22 | 45 | 69 | -24 |
| 16 | 愛媛 | 46 | 41 | 10 | 11 | 25 | 42 | 69 | -27 |
| 17 | 栃木 | 46 | 40 | 9 | 13 | 24 | 40 | 64 | -24 |
| 18 | 岡山 | 47 | 36 | 9 | 9 | 29 | 35 | 72 | -37 |
| 19 | 柏 | 11 | 27 | 8 | 3 | 0 | 16 | 4 | 12 |
| 20 | 千葉 | 12 | 24 | 7 | 3 | 2 | 23 | 11 | 12 |
| 21 | 大分 | 11 | 16 | 5 | 1 | 5 | 19 | 17 | 2 |
| 22 | 北九州 | 12 | 8 | 1 | 5 | 6 | 4 | 13 | -9 |
