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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 甲府 | 29 | 54 | 16 | 6 | 7 | 44 | 31 | 13 |
| 2 | 鳥栖 | 29 | 51 | 14 | 9 | 6 | 34 | 24 | 10 |
| 3 | 札幌 | 29 | 47 | 13 | 8 | 8 | 42 | 36 | 6 |
| 4 | 仙台 | 20 | 46 | 14 | 4 | 2 | 35 | 13 | 22 |
| 5 | 熊本 | 30 | 43 | 12 | 7 | 11 | 35 | 37 | -2 |
| 6 | C大阪 | 20 | 41 | 12 | 5 | 3 | 34 | 15 | 19 |
| 7 | 福岡 | 29 | 41 | 11 | 8 | 10 | 37 | 30 | 7 |
| 8 | 徳島 | 29 | 39 | 11 | 6 | 12 | 37 | 29 | 8 |
| 9 | 湘南 | 20 | 38 | 11 | 5 | 4 | 25 | 17 | 8 |
| 10 | 岐阜 | 30 | 38 | 11 | 5 | 14 | 42 | 41 | 1 |
| 11 | 横浜F | 30 | 37 | 11 | 4 | 15 | 36 | 43 | -7 |
| 12 | 群馬 | 30 | 34 | 10 | 4 | 16 | 29 | 47 | -18 |
| 13 | 愛媛 | 29 | 32 | 8 | 8 | 13 | 26 | 33 | -7 |
| 14 | 水戸 | 30 | 31 | 8 | 7 | 15 | 26 | 46 | -20 |
| 15 | 栃木 | 29 | 30 | 7 | 9 | 13 | 29 | 35 | -6 |
| 16 | 東京V | 29 | 30 | 8 | 6 | 15 | 32 | 40 | -8 |
| 17 | 岡山 | 30 | 26 | 7 | 5 | 18 | 27 | 47 | -20 |
| 18 | 富山 | 29 | 25 | 6 | 7 | 16 | 25 | 47 | -22 |
| 19 | 柏 | 9 | 23 | 7 | 2 | 0 | 13 | 3 | 10 |
| 20 | 千葉 | 10 | 20 | 6 | 2 | 2 | 20 | 9 | 11 |
| 21 | 大分 | 10 | 16 | 5 | 1 | 4 | 16 | 13 | 3 |
| 22 | 北九州 | 10 | 7 | 1 | 4 | 5 | 3 | 11 | -8 |
