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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 甲府 | 32 | 63 | 19 | 6 | 7 | 50 | 33 | 17 |
| 2 | 鳥栖 | 32 | 57 | 16 | 9 | 7 | 41 | 28 | 13 |
| 3 | 仙台 | 23 | 52 | 16 | 4 | 3 | 41 | 18 | 23 |
| 4 | 札幌 | 32 | 51 | 14 | 9 | 9 | 46 | 41 | 5 |
| 5 | C大阪 | 23 | 47 | 14 | 5 | 4 | 42 | 18 | 24 |
| 6 | 徳島 | 32 | 46 | 13 | 7 | 12 | 46 | 31 | 15 |
| 7 | 福岡 | 32 | 46 | 12 | 10 | 10 | 41 | 33 | 8 |
| 8 | 岐阜 | 33 | 44 | 13 | 5 | 15 | 45 | 45 | 0 |
| 9 | 熊本 | 33 | 43 | 12 | 7 | 14 | 40 | 47 | -7 |
| 10 | 横浜F | 33 | 40 | 12 | 4 | 17 | 39 | 49 | -10 |
| 11 | 水戸 | 33 | 40 | 11 | 7 | 15 | 33 | 48 | -15 |
| 12 | 湘南 | 23 | 38 | 11 | 5 | 7 | 27 | 22 | 5 |
| 13 | 群馬 | 33 | 35 | 10 | 5 | 18 | 30 | 51 | -21 |
| 14 | 東京V | 32 | 33 | 9 | 6 | 17 | 37 | 45 | -8 |
| 15 | 愛媛 | 32 | 32 | 8 | 8 | 16 | 27 | 43 | -16 |
| 16 | 富山 | 32 | 32 | 8 | 8 | 16 | 29 | 48 | -19 |
| 17 | 栃木 | 32 | 31 | 7 | 10 | 15 | 30 | 40 | -10 |
| 18 | 岡山 | 33 | 30 | 8 | 6 | 19 | 31 | 51 | -20 |
| 19 | 柏 | 9 | 23 | 7 | 2 | 0 | 13 | 3 | 10 |
| 20 | 千葉 | 10 | 20 | 6 | 2 | 2 | 20 | 9 | 11 |
| 21 | 大分 | 10 | 16 | 5 | 1 | 4 | 16 | 13 | 3 |
| 22 | 北九州 | 10 | 7 | 1 | 4 | 5 | 3 | 11 | -8 |
