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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 甲府 | 47 | 91 | 27 | 10 | 10 | 80 | 47 | 33 |
| 2 | 鳥栖 | 47 | 88 | 25 | 13 | 9 | 65 | 39 | 26 |
| 3 | 仙台 | 38 | 78 | 23 | 9 | 6 | 67 | 32 | 35 |
| 4 | C大阪 | 38 | 75 | 22 | 9 | 7 | 80 | 43 | 37 |
| 5 | 岐阜 | 48 | 68 | 19 | 11 | 18 | 65 | 61 | 4 |
| 6 | 湘南 | 38 | 67 | 19 | 10 | 9 | 63 | 43 | 20 |
| 7 | 徳島 | 47 | 67 | 18 | 13 | 16 | 65 | 54 | 11 |
| 8 | 札幌 | 47 | 67 | 17 | 16 | 14 | 63 | 58 | 5 |
| 9 | 東京V | 47 | 65 | 18 | 11 | 18 | 64 | 55 | 9 |
| 10 | 水戸 | 48 | 62 | 17 | 11 | 20 | 54 | 71 | -17 |
| 11 | 福岡 | 47 | 60 | 16 | 12 | 19 | 53 | 65 | -12 |
| 12 | 熊本 | 48 | 59 | 16 | 11 | 21 | 61 | 73 | -12 |
| 13 | 群馬 | 48 | 56 | 15 | 11 | 22 | 52 | 68 | -16 |
| 14 | 横浜F | 48 | 50 | 14 | 8 | 26 | 48 | 68 | -20 |
| 15 | 富山 | 47 | 49 | 12 | 13 | 22 | 42 | 71 | -29 |
| 16 | 愛媛 | 47 | 46 | 12 | 10 | 25 | 47 | 71 | -24 |
| 17 | 栃木 | 47 | 43 | 10 | 13 | 24 | 42 | 66 | -24 |
| 18 | 岡山 | 48 | 35 | 9 | 8 | 31 | 36 | 78 | -42 |
| 19 | 柏 | 9 | 23 | 7 | 2 | 0 | 13 | 3 | 10 |
| 20 | 千葉 | 10 | 20 | 6 | 2 | 2 | 20 | 9 | 11 |
| 21 | 大分 | 10 | 16 | 5 | 1 | 4 | 16 | 13 | 3 |
| 22 | 北九州 | 10 | 7 | 1 | 4 | 5 | 3 | 11 | -8 |
