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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 甲府 | 65 | 123 | 36 | 15 | 14 | 101 | 62 | 39 |
| 2 | C大阪 | 57 | 119 | 36 | 11 | 10 | 118 | 62 | 56 |
| 3 | 仙台 | 57 | 117 | 35 | 12 | 10 | 97 | 49 | 48 |
| 4 | 鳥栖 | 66 | 109 | 31 | 16 | 19 | 89 | 74 | 15 |
| 5 | 湘南 | 57 | 104 | 31 | 11 | 15 | 90 | 59 | 31 |
| 6 | 徳島 | 65 | 91 | 25 | 16 | 24 | 83 | 74 | 9 |
| 7 | 水戸 | 67 | 90 | 25 | 15 | 27 | 80 | 95 | -15 |
| 8 | 札幌 | 60 | 88 | 23 | 19 | 18 | 81 | 75 | 6 |
| 9 | 福岡 | 65 | 84 | 22 | 18 | 25 | 71 | 83 | -12 |
| 10 | 東京V | 60 | 82 | 23 | 13 | 24 | 77 | 71 | 6 |
| 11 | 熊本 | 66 | 82 | 22 | 16 | 28 | 81 | 95 | -14 |
| 12 | 岐阜 | 66 | 81 | 22 | 15 | 29 | 76 | 89 | -13 |
| 13 | 群馬 | 67 | 75 | 21 | 12 | 34 | 77 | 104 | -27 |
| 14 | 富山 | 60 | 68 | 17 | 17 | 26 | 56 | 79 | -23 |
| 15 | 横浜F | 67 | 66 | 17 | 15 | 35 | 65 | 93 | -28 |
| 16 | 愛媛 | 66 | 63 | 16 | 15 | 35 | 68 | 96 | -28 |
| 17 | 栃木 | 60 | 50 | 11 | 17 | 32 | 50 | 85 | -35 |
| 18 | 岡山 | 61 | 47 | 11 | 14 | 36 | 47 | 94 | -47 |
| 19 | 柏 | 9 | 23 | 7 | 2 | 0 | 13 | 3 | 10 |
| 20 | 千葉 | 10 | 20 | 6 | 2 | 2 | 20 | 9 | 11 |
| 21 | 山形 | 6 | 16 | 5 | 1 | 0 | 11 | 4 | 7 |
| 22 | 大分 | 10 | 16 | 5 | 1 | 4 | 16 | 13 | 3 |
| 23 | 広島 | 5 | 13 | 4 | 1 | 0 | 15 | 6 | 9 |
| 24 | 北九州 | 10 | 7 | 1 | 4 | 5 | 3 | 11 | -8 |
