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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 仙台 | 65 | 109 | 30 | 19 | 16 | 93 | 71 | 22 |
| 2 | 鳥栖 | 65 | 106 | 31 | 13 | 21 | 85 | 78 | 7 |
| 3 | 札幌 | 57 | 105 | 31 | 12 | 14 | 77 | 58 | 19 |
| 4 | 東京V | 57 | 101 | 29 | 14 | 14 | 104 | 75 | 29 |
| 5 | C大阪 | 57 | 93 | 28 | 9 | 20 | 83 | 68 | 15 |
| 6 | 湘南 | 64 | 93 | 28 | 9 | 27 | 94 | 87 | 7 |
| 7 | 京都 | 48 | 86 | 24 | 14 | 10 | 80 | 59 | 21 |
| 8 | 福岡 | 56 | 84 | 25 | 9 | 22 | 87 | 73 | 14 |
| 9 | 山形 | 64 | 84 | 22 | 18 | 24 | 72 | 71 | 1 |
| 10 | 愛媛 | 64 | 63 | 17 | 12 | 35 | 59 | 88 | -29 |
| 11 | 徳島 | 65 | 53 | 11 | 20 | 34 | 53 | 95 | -42 |
| 12 | 群馬 | 64 | 52 | 8 | 28 | 28 | 54 | 97 | -43 |
| 13 | 水戸 | 64 | 49 | 11 | 16 | 37 | 52 | 97 | -45 |
| 14 | 横浜F | 17 | 31 | 8 | 7 | 2 | 25 | 15 | 10 |
| 15 | 広島 | 8 | 17 | 5 | 2 | 1 | 17 | 7 | 10 |
| 16 | 柏 | 8 | 13 | 4 | 1 | 3 | 19 | 15 | 4 |
| 17 | 甲府 | 9 | 13 | 3 | 4 | 2 | 9 | 8 | 1 |
| 18 | 神戸 | 9 | 12 | 3 | 3 | 3 | 15 | 13 | 2 |
| 19 | 岐阜 | 9 | 11 | 3 | 2 | 4 | 18 | 16 | 2 |
| 20 | 熊本 | 8 | 5 | 1 | 2 | 5 | 8 | 13 | -5 |
