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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 仙台 | 68 | 112 | 31 | 19 | 18 | 99 | 77 | 22 |
| 2 | 鳥栖 | 68 | 112 | 33 | 13 | 22 | 88 | 81 | 7 |
| 3 | 札幌 | 59 | 111 | 33 | 12 | 14 | 89 | 59 | 30 |
| 4 | 東京V | 59 | 107 | 31 | 14 | 14 | 110 | 77 | 33 |
| 5 | 湘南 | 67 | 97 | 29 | 10 | 28 | 96 | 93 | 3 |
| 6 | C大阪 | 57 | 93 | 28 | 9 | 20 | 83 | 68 | 15 |
| 7 | 京都 | 48 | 86 | 24 | 14 | 10 | 80 | 59 | 21 |
| 8 | 山形 | 67 | 85 | 22 | 19 | 26 | 76 | 77 | -1 |
| 9 | 福岡 | 56 | 84 | 25 | 9 | 22 | 87 | 73 | 14 |
| 10 | 愛媛 | 67 | 70 | 19 | 13 | 35 | 63 | 90 | -27 |
| 11 | 群馬 | 67 | 56 | 9 | 29 | 29 | 58 | 102 | -44 |
| 12 | 徳島 | 68 | 54 | 11 | 21 | 36 | 53 | 102 | -49 |
| 13 | 水戸 | 67 | 49 | 11 | 16 | 40 | 53 | 102 | -49 |
| 14 | 横浜F | 20 | 37 | 10 | 7 | 3 | 31 | 20 | 11 |
| 15 | 広島 | 8 | 17 | 5 | 2 | 1 | 17 | 7 | 10 |
| 16 | 柏 | 11 | 17 | 5 | 2 | 4 | 23 | 18 | 5 |
| 17 | 神戸 | 11 | 15 | 4 | 3 | 4 | 19 | 18 | 1 |
| 18 | 甲府 | 9 | 13 | 3 | 4 | 2 | 9 | 8 | 1 |
| 19 | 岐阜 | 9 | 11 | 3 | 2 | 4 | 18 | 16 | 2 |
| 20 | 熊本 | 8 | 5 | 1 | 2 | 5 | 8 | 13 | -5 |
