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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 札幌 | 54 | 104 | 31 | 11 | 12 | 75 | 50 | 25 |
| 2 | 仙台 | 60 | 102 | 29 | 15 | 16 | 86 | 65 | 21 |
| 3 | 東京V | 54 | 97 | 28 | 13 | 13 | 98 | 68 | 30 |
| 4 | 鳥栖 | 60 | 96 | 28 | 12 | 20 | 79 | 74 | 5 |
| 5 | 湘南 | 60 | 90 | 27 | 9 | 24 | 87 | 77 | 10 |
| 6 | C大阪 | 55 | 89 | 27 | 8 | 20 | 81 | 67 | 14 |
| 7 | 京都 | 48 | 86 | 24 | 14 | 10 | 80 | 59 | 21 |
| 8 | 山形 | 59 | 81 | 22 | 15 | 22 | 69 | 65 | 4 |
| 9 | 福岡 | 54 | 80 | 24 | 8 | 22 | 85 | 73 | 12 |
| 10 | 愛媛 | 59 | 56 | 15 | 11 | 33 | 49 | 81 | -32 |
| 11 | 群馬 | 61 | 50 | 8 | 26 | 27 | 51 | 91 | -40 |
| 12 | 水戸 | 59 | 47 | 11 | 14 | 34 | 48 | 89 | -41 |
| 13 | 徳島 | 60 | 45 | 9 | 18 | 33 | 43 | 88 | -45 |
| 14 | 横浜F | 13 | 21 | 5 | 6 | 2 | 17 | 12 | 5 |
| 15 | 広島 | 6 | 14 | 4 | 2 | 0 | 14 | 4 | 10 |
| 16 | 岐阜 | 7 | 11 | 3 | 2 | 2 | 14 | 9 | 5 |
| 17 | 柏 | 6 | 10 | 3 | 1 | 2 | 14 | 11 | 3 |
| 18 | 甲府 | 7 | 7 | 1 | 4 | 2 | 6 | 7 | -1 |
| 19 | 熊本 | 6 | 5 | 1 | 2 | 3 | 7 | 10 | -3 |
| 20 | 神戸 | 6 | 3 | 0 | 3 | 3 | 8 | 11 | -3 |
