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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 札幌 | 55 | 104 | 31 | 11 | 13 | 76 | 54 | 22 |
| 2 | 仙台 | 61 | 103 | 29 | 16 | 16 | 86 | 65 | 21 |
| 3 | 鳥栖 | 61 | 99 | 29 | 12 | 20 | 82 | 75 | 7 |
| 4 | 東京V | 55 | 98 | 28 | 14 | 13 | 100 | 70 | 30 |
| 5 | 湘南 | 61 | 90 | 27 | 9 | 25 | 87 | 78 | 9 |
| 6 | C大阪 | 55 | 89 | 27 | 8 | 20 | 81 | 67 | 14 |
| 7 | 京都 | 48 | 86 | 24 | 14 | 10 | 80 | 59 | 21 |
| 8 | 山形 | 60 | 81 | 22 | 15 | 23 | 70 | 68 | 2 |
| 9 | 福岡 | 54 | 80 | 24 | 8 | 22 | 85 | 73 | 12 |
| 10 | 愛媛 | 60 | 59 | 16 | 11 | 33 | 54 | 83 | -29 |
| 11 | 群馬 | 62 | 50 | 8 | 26 | 28 | 53 | 96 | -43 |
| 12 | 水戸 | 60 | 48 | 11 | 15 | 34 | 48 | 89 | -41 |
| 13 | 徳島 | 61 | 46 | 9 | 19 | 33 | 45 | 90 | -45 |
| 14 | 横浜F | 14 | 24 | 6 | 6 | 2 | 18 | 12 | 6 |
| 15 | 広島 | 6 | 14 | 4 | 2 | 0 | 14 | 4 | 10 |
| 16 | 岐阜 | 7 | 11 | 3 | 2 | 2 | 14 | 9 | 5 |
| 17 | 柏 | 6 | 10 | 3 | 1 | 2 | 14 | 11 | 3 |
| 18 | 甲府 | 7 | 7 | 1 | 4 | 2 | 6 | 7 | -1 |
| 19 | 神戸 | 7 | 6 | 1 | 3 | 3 | 12 | 12 | 0 |
| 20 | 熊本 | 6 | 5 | 1 | 2 | 3 | 7 | 10 | -3 |
