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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 札幌 | 59 | 111 | 33 | 12 | 14 | 89 | 59 | 30 |
| 2 | 仙台 | 66 | 110 | 31 | 17 | 18 | 95 | 73 | 22 |
| 3 | 鳥栖 | 66 | 109 | 32 | 13 | 21 | 86 | 78 | 8 |
| 4 | 東京V | 59 | 107 | 31 | 14 | 14 | 110 | 77 | 33 |
| 5 | 湘南 | 66 | 94 | 28 | 10 | 28 | 92 | 91 | 1 |
| 6 | C大阪 | 55 | 89 | 27 | 8 | 20 | 81 | 67 | 14 |
| 7 | 京都 | 48 | 86 | 24 | 14 | 10 | 80 | 59 | 21 |
| 8 | 山形 | 65 | 83 | 22 | 17 | 26 | 75 | 76 | -1 |
| 9 | 福岡 | 54 | 80 | 24 | 8 | 22 | 85 | 73 | 12 |
| 10 | 愛媛 | 65 | 69 | 19 | 12 | 34 | 62 | 88 | -26 |
| 11 | 群馬 | 66 | 55 | 9 | 28 | 29 | 57 | 101 | -44 |
| 12 | 徳島 | 66 | 51 | 10 | 21 | 35 | 50 | 100 | -50 |
| 13 | 水戸 | 65 | 48 | 11 | 15 | 39 | 50 | 97 | -47 |
| 14 | 横浜F | 18 | 33 | 9 | 6 | 3 | 27 | 17 | 10 |
| 15 | 柏 | 11 | 17 | 5 | 2 | 4 | 23 | 18 | 5 |
| 16 | 神戸 | 11 | 15 | 4 | 3 | 4 | 19 | 18 | 1 |
| 17 | 広島 | 6 | 14 | 4 | 2 | 0 | 14 | 4 | 10 |
| 18 | 岐阜 | 7 | 11 | 3 | 2 | 2 | 14 | 9 | 5 |
| 19 | 甲府 | 7 | 7 | 1 | 4 | 2 | 6 | 7 | -1 |
| 20 | 熊本 | 6 | 5 | 1 | 2 | 3 | 7 | 10 | -3 |
