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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 札幌 | 55 | 104 | 31 | 11 | 13 | 76 | 54 | 22 |
| 2 | 仙台 | 59 | 101 | 29 | 14 | 16 | 84 | 63 | 21 |
| 3 | 東京V | 55 | 98 | 28 | 14 | 13 | 100 | 70 | 30 |
| 4 | 鳥栖 | 59 | 95 | 28 | 11 | 20 | 79 | 73 | 6 |
| 5 | C大阪 | 53 | 89 | 27 | 8 | 18 | 78 | 60 | 18 |
| 6 | 京都 | 48 | 86 | 24 | 14 | 10 | 80 | 59 | 21 |
| 7 | 湘南 | 59 | 84 | 25 | 9 | 25 | 84 | 77 | 7 |
| 8 | 福岡 | 52 | 80 | 24 | 8 | 20 | 83 | 65 | 18 |
| 9 | 山形 | 58 | 75 | 20 | 15 | 23 | 67 | 67 | 0 |
| 10 | 愛媛 | 59 | 59 | 16 | 11 | 32 | 53 | 81 | -28 |
| 11 | 群馬 | 60 | 49 | 8 | 25 | 27 | 51 | 93 | -42 |
| 12 | 水戸 | 59 | 47 | 11 | 14 | 34 | 46 | 87 | -41 |
| 13 | 徳島 | 59 | 42 | 8 | 18 | 33 | 41 | 88 | -47 |
| 14 | 横浜F | 12 | 23 | 6 | 5 | 1 | 17 | 10 | 7 |
| 15 | 広島 | 4 | 10 | 3 | 1 | 0 | 9 | 2 | 7 |
| 16 | 柏 | 6 | 10 | 3 | 1 | 2 | 14 | 11 | 3 |
| 17 | 岐阜 | 5 | 7 | 2 | 1 | 2 | 8 | 7 | 1 |
| 18 | 神戸 | 7 | 6 | 1 | 3 | 3 | 12 | 12 | 0 |
| 19 | 甲府 | 5 | 4 | 0 | 4 | 1 | 3 | 4 | -1 |
| 20 | 熊本 | 4 | 4 | 1 | 1 | 2 | 4 | 6 | -2 |
